Die E.C. 6-klas ligase-ensieme sluit sintases en sintetases in. Hulle neem deel aan sintetiese reaksies en kataliseer die samevoeging van twee molekules terwyl hulle terselfdertyd die difosfaatskakel in ATP of 'n ander vergelykbare trifosfaat breek.

In teenstelling met sintetases, wat ATP as 'n bron van energie tydens die sintese gebruik. van biologiese verbindings, sintases is enige ligase wat die sintese van biologiese verbindings kataliseer sonder om ATP as 'n energiebron te gebruik.

In hierdie artikel leer jy presies die verskil tussen Sintase en Sintetase ken.

Wat is Sintase?

'n Sintase is 'n ensiem wat die sinteseproses in biochemie kataliseer. Hou in gedagte dat die biologiese nomenklatuur aanvanklik tussen sintetases en sintases onderskei het.

In ooreenstemming met die oorspronklike definisie, gebruik sintetases nukleosiedtrifosfate (soos ATP, GTP, CTP, TTP en UTP) as 'n bron van energie terwyl sintases dit nie doen nie.

Desnieteenstaande, volgens die Joint Commission on Biochemical Nomenclature (JCBN), kan "sintase" gebruik word om te verwys na enige ensiem wat sintese kataliseer (ongeag of dit nukleosiedtrifosfate gebruik), maar "sintetase". ” moet slegs gebruik word om na “ligase” te verwys.

Hier is 'n lys voorbeelde van verskillende tipes sintase:

• ATP-sintase
• Sitraat sintase
• Tryptofaankan gebruik word om te verwys na enige ensiem wat sintese kataliseer (ongeag of dit nukleosiedtrifosfate gebruik), maar "sintetase" moet slegs gebruik word om na "ligase" te verwys.

  Die primêre onderskeid tussen Sintase en Sintetase is dat Sintetase 'n familie van ensieme is wat bindings tussen molekules kan genereer, terwyl Syntase 'n ensiem is.

  Sintase	Sintetase
  Kataliseer 'n sintetiese proses sonder ATP	Vereis ATP
  Kom onder vaas- of transferase-klassifikasie	Kom onder ligase klassifikasie
  bv. HMG-COA sintase, ATP sintase	bv. Succiny1-COA sintetase, Glutamine sintetase

  Sintase vs sintetase vergelyking tabel

  Kyk hierdie video om te weet oor sintase vs sintetase

  Gevolgtrekking

  • Sintetases het nie NTP's nodig om te funksioneer nie, aangesien hulle sintetiese prosesse gekataliseer het wat die hidrolise van nukleosiedtrifosfate vereis het (nie bloot ATP nie).
  • The International Union of Biochemie se nomenklatuurkomitee het die definisie van sintase in die 1980's verander om alle sintetiese ensieme in te sluit, of hulle NTP's gebruik het of nie, en sintetase het sinoniem geword met ligase.
  • Ligase is 'n ensiem wat twee kleiner molekules saamvoeg deur die gebruik van die energie van NTP-hidrolise (gewoonlik deur 'n kondensasiereaksie).
  sintase
• Pseudouridien sintase
• Vetsure sintase
• Sellulose sintase (UDP-vormende)
• Sellulose sintase (BBP-vormende)

ATP-sintase

Adenosiendifosfaat (ADP) en anorganiese fosfaat word gebruik om die energiebergingsmolekule adenosientrifosfaat (ATP) te skep deur 'n proteïen genaamd ATP-sintase (Pi).

Dit word as 'n ligase gekategoriseer aangesien dit ADP wysig deur 'n P-O-skakel (fosfodiesterbinding) te vorm. 'n Molekulêre toestel genaamd ATP-sintase.

Energiegewys is die produksie van ATP vanaf ADP en Pi ongewens, en die proses sal tipies andersom gaan.

'n Proton (H+) konsentrasiegradiënt oor die binneste mitochondriale membraan in eukariote of die plasmamembraan in bakterieë dryf hierdie reaksie vorentoe deur ATP-sintese tydens sellulêre respirasie aan die gradiënt te koppel.

In plante gebruik ATP-sintase 'n protongradiënt wat in die tilakoïedlumen oor die tilakoïedmembraan en in die chloroplaststroma gevorm word om ATP tydens fotosintese te produseer.

Vir 'n ATPase is eukariotiese ATP-sinteses F -ATPases wat "in omgekeerde" funksioneer. Hierdie soort word hoofsaaklik in hierdie artikel bespreek. Die FO- en F1-subeenhede van 'n F-ATPase het 'n rotasie-motoriese meganisme wat ATP-sintese moontlik maak.

Daar is verskillende tipes Sintase

Sitraatsintese

Byna alle lewende selle bevat die ensiem sitraat sintase,wat dien as 'n pasaangeër in die eerste stap van die sitroensuursiklus en is aangewys as E.C. 2.3.3.1 (voorheen 4.1.3.7). (of Krebs-siklus).

Sitraatsintese is in die mitochondriale matriks van eukariotiese selle geleë, alhoewel kern-DNS, nie mitochondriale DNA, dit kodeer.

Dit word in die sitoplasma deur sitoplasmiese ribosome geskep en daarna in die mitochondriale matriks inbeweeg.

'n Tipiese kwantitatiewe ensiemmerker vir die bestaan ​​van ongeskonde mitochondria is sitraatsintase. Sitraatsintase se piekaktiwiteit onthul hoeveel mitochondria in skeletspier teenwoordig is.

Hoë-intensiteit-interval-oefening het die potensiaal om maksimum aktiwiteit meer te verhoog as óf uithouvermoë-oefening óf hoë-intensiteit-interval-oefening.

Asetielkoënsiem A het tweekoolstofasetaatresidu en 'n molekule van vier -koolstofoksalosetaat kondenseer om ses-koolstof-sitraat te genereer, wat geproduseer word deur die kondensasiereaksie wat deur sitraatsintase gekataliseer word.

Triptofaansintase

Die laaste twee stappe in die produksie van triptofaan is gekataliseer deur die ensiem triptofaan sintase, ook bekend as triptofaan sintetase.

Eubacteria, Archaebacteria, Protista, Fungi en Plantae is gereelde gashere daarvoor. Animalia het dit egter nie. Gewoonlik verskyn dit as 'n 2 2 tetrameer.

Die subeenhede kataliseer die omkeerbare omskakeling van indool-3-gliserolfosfaat naindool en gliseraldehied-3-fosfaat (G3P) (IGP).

In 'n piridoksaalfosfaat (PLP) afhanklike proses kataliseer die subeenhede die onomkeerbare kondensasie van indool en serien om triptofaan te genereer.

'n Interne hidrofobiese kanaal wat 25 Angstrom lank is en in die ensiem geleë is, verbind elke aktiewe plek met die aangrensende aktiewe plek.

Dit bevorder substraatkanalisering, 'n meganisme waardeur indool op aktiewe plekke geproduseer word. diffundeer direk na ander aktiewe terreine. Tryptofaansintase bevat allosteries-gekoppelde aktiewe terreine.

Eubacteria, Archaebacteria, Protista, Fungi en Plantae word gereeld ontdek om triptofaansintase in te sluit. Mense en ander diere kort dit.

Een van die nege noodsaaklike aminosure vir mense, triptofaan is een van die twintig standaard aminosure. Triptofaan is dus noodsaaklik vir die menslike dieet.

Dit is ook bekend dat triptofaansintetase indoolanaloë, soos gefluoreerde of gemetileerde indole, as substrate kan gebruik om die ekwivalente triptofaananaloë te produseer.

Pseudouridien

Die Griekse letter psi- word gebruik om pseudouridien, 'n isomeer van die nukleosied uridien, waarin die uracil deur 'n koolstof-koolstof-skakel eerder as 'n stikstof-koolstof-glikosidiese verbinding aan die koolstofatoom verbind is, af te kort. (In hierdie rangskikking word soms na uracil verwys as "pseudouracil".)

Die mees algemene RNAverandering in sellulêre RNA is pseudouridien. RNA kan meer as 100 chemies unieke veranderings ondergaan tydens transkripsie en sintese.

Benewens die vier konvensionele nukleotiede, kan dit moontlik RNA-uitdrukking post-transkripsie beïnvloed en 'n aantal funksies in die sel hê, insluitend RNA-translasie, lokalisering en stabiliteit.

Een hiervan is pseudouridien, 'n C5-glikosied-isomeer van uridien met 'n C-C-binding tussen die C1 van die ribosesuiker en die C5 van uracil in die plek van die tipiese C1-N1-binding wat in uridien voorkom.

Dit het bykomende rotasie-mobiliteit en konformasie-buigsaamheid as gevolg van die C-C-binding. Daarbenewens beskik die N1-posisie van pseudouridien oor 'n bykomende waterstofbindingskenker.

Pseudouridien, ook genoem 5-ribosyluracil, is 'n bekende dog geheimsinnige komponent van strukturele RNA's (oordrag, ribosomale, klein kern (snRNA), en klein kern). Dit is onlangs ook in kodende RNA gevind.

Dit was die eerste wat opgespoor is, is die algemeenste en kan gevind word in al drie evolusionêre domeine van die lewe. In die gis-tRNA maak pseudouridien ongeveer 4% van die nukleotiede uit

Deur die vorming van bykomende waterstofbindings met water is hierdie basisverandering in staat om RNA te stabiliseer en basisstapeling te verbeter.

Die aantal pseudouridiene groei met 'n organisme se kompleksiteit. Daar is 11 pseudouridiene indie rRNA van Escherichia coli, 30 in die sitoplasmiese rRNA van gis, een verandering in die mitochondriale 21S rRNA, en ongeveer 100 in die rRNA van mense.

Dit is gedemonstreer dat pseudouridien in rRNA en tRNA fyn instel en stabiliseer die streekstruktuur en help met die handhawing van hul rolle in mRNA-dekodering, ribosoomsamestelling, verwerking en translasie.

Dit is gedemonstreer dat pseudouridien in snRNA die koppelvlak tussen pre-mRNA en die spliceosomale RNA verbeter om te help om splyting te reguleer.

Vetsuursintese

Die FASN geen in mense kodeer vir die ensiem bekend as vetsuursintase (FAS). 'n Multi-ensiem proteïen genoem vetsuur sintase kataliseer die sintese van vetsure.

Dit is 'n hele ensiematiese stelsel, nie net een ensiem nie, wat bestaan ​​uit twee identiese 272 kDa multifunksionele polipeptiede wat substrate van een funksionele domein na die volgende oordra.

Sy primêre taak is om NADPH te gebruik om die skepping van palmitaat (C16:0, 'n langketting versadigde vetsuur) van asetiel- en maloniel-CoA te kataliseer.

Asetiel-CoA en malonyl -CoA word omgeskakel in vetsure deur 'n reeks dekarboksilatiewe Claisen-kondensasieprosesse.

Na elke rondte van verlenging werk 'n ketoreduktase (KR), dehidrase (DH) en enoielreduktase in volgorde om die beta-keto-groep na die heeltemal versadigde koolstofketting te verminder(ER).

Wanneer die vetsuurketting tot 'n lengte van 16 koolstofstowwe gegroei het, word dit vrygestel deur die werking van 'n tioesterase (TE), wat kovalent gekoppel is aan die fosfopanteïenprostetiese groep van 'n asieldraerproteïen (ACP) (palmitensuur).

Sellulose-sintase (UDP-vormend)

Die primêre ensiem wat verantwoordelik is vir die vervaardiging van sellulose is sellulose-sintase (EC 2.4.1.12) in sy UDP-vormende vorm. Dit word algemeen na verwys as UDP-glukose: (1→4) Ensiemologie se 4-D-glukosieltransferase vir D-glukose.

BBP-glukose word gebruik deur 'n verwante ensiem genaamd sellulose sintase (BBP- vorming) (EC 2.4.1.29). Beide bakterieë en plante het lede van hierdie familie van ensieme.

Bakteriese lede kan ook bekend staan ​​as BcsA (bakteriese sellulose sintase) of CelA, terwyl plantlede tipies bekend staan ​​as CesA (sellulose sintase) of die spekulatiewe CslA (sellulose sintase-agtig) (eenvoudig "sellulose"). .

CesA is deur plante verkry as gevolg van die endosimbiose wat aanleiding gegee het tot die chloroplast. Familie 2 van die glukosieltransferases sluit hierdie een (GT2) in.

Die meerderheid van die biomassa op Aarde word geproduseer deur biosintese en hidrolise deur ensieme wat glikosieltransferases genoem word.

Dit is bekend dat die plant CesA-superfamilie bevat sewe subfamilies, en die gekombineerde plant-alge superfamilie bevat 10.

Die enigste diergroep wat hierdie ensiem besit, is dieurochordates, wat dit meer as 530 miljoen jaar gelede deur horisontale geenoordrag verkry het.

Sellulose-sintase (BBP-vormend)

Hierdie ensiem is 'n lid van die heksosieltransferase-subfamilie van glikosieltransferases. Daar word na hierdie ensiemklas verwys met sy wetenskaplike naam, BBP-glukose:1,4-beta-D-glukan 4-beta-D-glukosieltransferase.

Ander name wat gereeld gebruik word, is sellulosesintase (guanosiendifosfaatvormende), sellulosesintetase en guanosiendifosfoglukose-1,4-beta-glukaanglukosieltransferase. Hierdie ensiem is betrokke by die metabolisme van sukrose en stysel.

Wat is Sintetase?

Die term "sintetase", soms bekend as "ligase," verwys na enige een van 'n klas van ongeveer 50 ensieme wat chemiese energiebesparende reaksies kataliseer en bemiddel tussen energieverbruikende afbreekgebeure en produktiewe sintetiese prosesse.

Deur 'n energieke fosfaatbinding te splits, genereer hulle die nodige energie om die kombinasie van twee molekules te kataliseer (in baie gevalle, deur die gelyktydige omskakeling van adenosientrifosfaat [ATP] na adenosiendifosfaat [ADP]) .

'n Ligase bekend as 'n aminosuur-RNA-ligase is een wat die skepping van 'n koolstof-suurstofbinding tussen 'n oordrag-RNA en 'n aminosuur kataliseer.

Wanneer sekere ensieme, soos amiedsintetases en peptiedsintetases, aktief is, koolstof-stikstof (C-N)bindings word geproduseer.

Sintetase staan ​​ook bekend as Ligase

Verskil tussen Sintetase en Sintase

'n Sintetase is 'n ensiem wat die binding van twee groot molekules deur 'n nuwe chemiese binding te skep, tipies met die gelyktydige hidrolise van 'n klein aanhangende chemiese groep op een van die groter molekules, of dit kan die koppeling van twee verbindings kataliseer, soos die koppeling van C-O, C-S, C-N, ens.

'n Ligase veroorsaak tipies dat die volgende reaksie plaasvind:

• A-C + b = Ab + C
• A+D + B + C + D + E + F = Ab + cD

Waar die afhanklike, klein groepies deur kleinletters voorgestel word. Ligase kan enkelstring-breuke herstel wat in dubbelstrengs DNA ontwikkel tydens replikasie asook twee komplementêre nukleïensuurfragmente koppel.

Aan die ander kant is sintase 'n ensiem wat die sinteseproses in biochemie kataliseer. Hulle is ingesluit in die kategorie liases volgens die EC-nommerkategorisering.

Nomenklatuur

Hou in gedagte dat die biologiese nomenklatuur aanvanklik tussen sintetases en sintases onderskei het. In ooreenstemming met die oorspronklike definisie, gebruik sintetases nukleosiedtrifosfate (soos ATP, GTP, CTP, TTP en UTP) as 'n bron van energie terwyl sintases dit nie doen nie.

Desnieteenstaande, volgens die Joint Commission on Biochemical Nomenclature (JCBN), "sintase"