Liqaza fermentlərinin E.C. 6 sinfinə sintaza və sintetaza daxildir. Onlar sintetik reaksiyalarda iştirak edir və iki molekulun birləşməsini kataliz edir, eyni zamanda ATP və ya digər müqayisə olunan trifosfatda difosfat bağını pozur.

Sintez zamanı ATP-dən enerji mənbəyi kimi istifadə edən sintetazalardan fərqli olaraq. bioloji birləşmələr, sintazalar enerji mənbəyi kimi ATP istifadə etmədən bioloji birləşmələrin sintezini kataliz edən hər hansı ligazalardır.

Bu məqalədə siz Sintaza və Sintetaza arasındakı fərqi dəqiq öyrənəcəksiniz.

Sintaza Nədir?

Sintaza biokimyada sintez prosesini kataliz edən fermentdir. Unutmayın ki, bioloji nomenklatura əvvəlcə sintetaza və sintaza ayırdı.

İlkin tərifə uyğun olaraq, sintetazalar nukleozid trifosfatlardan (ATP, GTP, CTP, TTP və UTP kimi) enerji mənbəyi kimi istifadə edir, sintazalar isə istifadə etmir.

Bununla belə, Biokimyəvi Nomenklatura üzrə Birgə Komissiyaya (JCBN) görə, "sintaza" sintezi kataliz edən hər hansı fermentə (nükleozid trifosfatlardan istifadə etməsindən asılı olmayaraq) istinad etmək üçün istifadə edilə bilər, lakin "sintetaza" ” yalnız “ligaza”ya istinad etmək üçün istifadə edilməlidir.

Müxtəlif növ sintaza nümunələrinin siyahısı:

• ATP sintaza
• Sitrat sintaza
• Triptofansintezi kataliz edən hər hansı bir fermentə istinad etmək üçün istifadə edilə bilər (nükleozid trifosfatlardan istifadə edib-etməməsindən asılı olmayaraq), lakin "sintetaza" yalnız "liqaza"ya istinad etmək üçün istifadə edilməlidir.

  Sintaz və Sintetaza arasındakı əsas fərq ki, Sintetaza molekullar arasında əlaqə yarada bilən fermentlər ailəsidir, Sintaza isə fermentdir.

  Sintaz	Sintetaza
  ATP olmadan sintetik prosesi kataliz edir	ATP tələb edir
  Vaza və ya transferaz təsnifatı altındadır	Liqaza təsnifatına daxil olur
  məs. HMG-COA sintaza, ATP sintaza	məs. Succiny1-COA sintetaza, Qlutamin sintetaza

  Sintaz vs Sintetaza Müqayisə cədvəli

  Sintaz vs Sintetaza Haqqında Bilmək üçün Bu Videoya Baxın

  Nəticə

  • Sintetazaların işləməsi üçün NTP-lərə ehtiyac yoxdur, çünki onlar nukleozid trifosfatların (sadəcə ATP deyil) hidrolizini tələb edən sintetik prosesləri katalizləyirdilər.
  • Beynəlxalq İttifaqı Biokimyanın Nomenklatura Komitəsi 1980-ci illərdə sintazanın tərifini dəyişdirərək, NTP-lərdən istifadə edib-etməməsindən asılı olmayaraq bütün sintetik fermentləri əhatə etdi və sintetaza liqaza ilə sinonim oldu.
  • Liqaza iki kiçik molekulu birləşdirən bir fermentdir. NTP hidrolizindən enerji (adətən kondensasiya yolu ilə).reaksiya).
  sintaza
• Pseudouridin sintaza
• Yağ turşusu sintaza
• Sellüloza sintaza (UDP əmələ gətirən)
• Sellüloza sintaza (ÜDM əmələ gətirən)

ATP Sintaza

Adenozin difosfat (ADP) və qeyri-üzvi fosfat, ATP sintaza (Pi) adlı bir protein tərəfindən enerji saxlama molekulu adenozin trifosfat (ATP) yaratmaq üçün istifadə olunur.

P-O əlaqəsi (fosfodiester bağı) yaratmaqla ADP-ni dəyişdirdiyi üçün ligaza kimi təsnif edilir. ATP sintaza adlı molekulyar cihaz.

Enerji baxımından ADP və Pi-dən ATP istehsalı arzuolunmazdır və proses adətən başqa cür gedir.

Eukariotlarda daxili mitoxondrial membranda və ya bakteriyalarda plazma membranında proton (H+) konsentrasiyası qradiyenti hüceyrə tənəffüsü zamanı ATP sintezini gradientə birləşdirərək bu reaksiyanı irəli aparır.

Bitkilərdə ATP sintaza fotosintez zamanı ATP istehsal etmək üçün tilakoid membranı boyunca tilakoid lümenində və xloroplast stromasında əmələ gələn proton qradiyentindən istifadə edir.

ATFaz üçün eukaryotik ATP sintazaları F-dir. -"Tərsinə" funksiyanı ATP edir. Bu növ ilk növbədə bu məqalədə müzakirə olunur. F-ATPase-nin FO və F1 alt bölmələri ATP sintezini təmin edən fırlanan motor mexanizminə malikdir.

Müxtəlif növ Sintaza var

Sitrat Sintaza

Demək olar ki, bütün canlı hüceyrələrdə sitrat sintaza fermenti var,limon turşusu dövrünün ilk pilləsində kardiostimulyator kimi xidmət edir və E.C. 2.3.3.1 (əvvəllər 4.1.3.7) ilə təyin olunur. (və ya Krebs dövrü).

Sitrat sintaza eukaryotik hüceyrələrin mitoxondrial matrisində yerləşir, baxmayaraq ki, mitoxondrial DNT deyil, nüvə DNT onu kodlayır.

O, sitoplazmada sitoplazmatik ribosomlar tərəfindən yaradılır və sonradan mitoxondrial matrisə köçürülür.

Tam olmayan mitoxondriyanın mövcudluğu üçün tipik kəmiyyət ferment markeri sitrat sintazadır. Sitrat sintazasının pik fəaliyyəti skelet əzələsində nə qədər mitoxondriyanın olduğunu göstərir.

Yüksək intensivlikli intervallı məşq, dözümlülük və ya yüksək intensivlikli interval məşqlərindən daha çox maksimum fəaliyyəti artırmaq potensialına malikdir.

Asetil koenzim A iki karbonlu asetat qalığına və dörd molekula malikdir. -karbon oksaloasetat altı karbonlu sitrat yaratmaq üçün kondensasiya olunur ki, bu da sitrat sintaza tərəfindən kataliz edilən kondensasiya reaksiyası nəticəsində əmələ gəlir.

Triptofan sintaza

Triptofanın istehsalında son iki addım aşağıdakılardır. Triptofan sintetaza kimi də tanınan triptofan sintaza fermenti tərəfindən kataliz edilir.

Eubakteriyalar, Arxebakteriyalar, Protistalar, Göbələklər və Plantaelər onun tez-tez sahibləridir. Ancaq Animalia-da bu yoxdur. Adətən, 2 2 tetramer kimi görünür.

Alt vahidlər indol-3-qliserin fosfatın geri çevrilə bilən çevrilməsini katalizləyir.indol və gliseraldehid-3-fosfat (G3P) (IGP).

Piridoksal fosfatdan (PLP) asılı prosesdə subunitlər triptofan yaratmaq üçün indol və serinin geri dönməz kondensasiyasını katalizləyir.

25 angstrom uzunluğunda olan və fermentdə yerləşən daxili hidrofobik kanal hər bir aktiv sahəni qonşu aktiv sahə ilə birləşdirir.

Bu, substratın kanalizasiyasını təşviq edir, bu mexanizm aktiv yerlərdə indol əmələ gətirir. birbaşa digər aktiv sahələrə yayılır. Triptofan sintaza allosterik olaraq birləşmiş aktiv yerləri ehtiva edir.

Eubakteriyalar, Arxebakteriyalar, Protistalar, Göbələklər və Plantalar tez-tez triptofan sintazasını ehtiva edir. İnsanlarda və digər heyvanlarda buna ehtiyac yoxdur.

İnsanlar üçün zəruri olan doqquz amin turşusundan biri olan triptofan iyirmi standart amin turşusundan biridir. Buna görə də triptofan insan pəhrizi üçün vacibdir.

Həmçinin məlumdur ki, triptofan sintetaza ekvivalent triptofan analoqlarını istehsal etmək üçün substrat kimi flüorlaşdırılmış və ya metilləşdirilmiş indollar kimi indol analoqlarından istifadə edə bilər.

Pseudouridin

Yunan hərfi psi- psevduridin qısaldılması üçün istifadə olunur, urasil azot-karbon qlikozid əlaqəsi ilə deyil, karbon atomu ilə karbon-karbon əlaqəsi ilə birləşən nukleozid uridinin izomeridir. (Urasil bəzən bu tənzimləmədə “psevdourasil” olaraq adlandırılır.)

Ən çox yayılmış RNTHüceyrə RNT-də dəyişiklik psevduridindir. RNT transkripsiya və sintez zamanı 100-dən çox kimyəvi unikal dəyişikliyə məruz qala bilər.

Dörd şərti nukleotiddən əlavə, bunlar RNT ifadəsinə post-transkripsiyaya təsir göstərə bilər və hüceyrədə RNT-nin tərcüməsi, lokalizasiyası və sabitliyi də daxil olmaqla bir sıra funksiyalara malikdir.

Bunlardan biri uridində mövcud olan tipik C1-N1 bağının əvəzinə riboza şəkərinin C1 ilə urasilin C5 arasında C-C bağına malik uridinin C5-qlikozid izomeri olan psevduridindir.

C-C bağına görə əlavə fırlanma hərəkətliliyinə və konformasiya elastikliyinə malikdir. Bundan əlavə, psevdoridinin N1 mövqeyi əlavə hidrogen bağı donoruna malikdir.

5-ribosilurasil də adlandırılan psevdoridin struktur RNT-lərin (transfer, ribosomal, kiçik nüvə (snRNA) və) tanış, lakin sirli komponentidir. kiçik nüvəli). Bu yaxınlarda RNT kodlaşdırmasında da tapıldı.

O, aşkar edilən ilk idi, ən çox yayılmışdır və həyatın hər üç təkamül sahəsində tapıla bilər. Maya tRNT-də pseudouridin nukleotidlərin təxminən 4%-ni təşkil edir

Su ilə əlavə hidrogen bağlarının əmələ gəlməsi ilə bu əsas dəyişikliyi RNT-ni stabilləşdirə və baza yığılmasını gücləndirə bilir.

Pseudouridinlərin sayı orqanizmin mürəkkəbliyi ilə artır. Tərkibində 11 pseudouridin varEscherichia coli-nin rRNT-si, mayanın sitoplazmik rRNT-də 30, mitoxondrial 21S rRNT-də bir dəyişiklik və insanların rRNT-sində təxminən 100.

Pseudouridin-in rNARNT-də və incə tunetlərdə olduğu nümayiş etdirilmişdir. və regional strukturu sabitləşdirir və mRNT-nin deşifrə edilməsində, ribosomların yığılmasında, emalında və tərcüməsində onların rollarının saxlanmasına kömək edir.

Nümayiş edilmişdir ki, snRNT-dəki psevduridin splicingi tənzimləmək üçün pre-mRNT və spliceosomal RNT arasındakı interfeysi yaxşılaşdırır.

Yağ turşusu sintazı

FASN İnsanlarda olan gen yağ turşusu sintaza (FAS) kimi tanınan fermenti kodlayır. Yağ turşusu sintaza adlı çox fermentli zülal yağ turşularının sintezini katalizləyir.

Bu, substratları bir funksional sahədən digərinə ötürən iki eyni 272 kDa çoxfunksiyalı polipeptiddən ibarət olan tək bir ferment deyil, bütöv bir enzimatik sistemdir.

Onun əsas işi asetil- və malonil-CoA

Asetil-CoA və malonildən palmitatın (C16:0, uzun zəncirli doymuş yağ turşusu) yaradılmasını kataliz etmək üçün NADPH-dən istifadə etməkdir. -CoA dekarboksilləşdirici Claisen kondensasiya prosesləri ilə ardıcıl olaraq yağ turşularına çevrilir.

Uzunmanın hər raundundan sonra ketoreduktaza (KR), dehidrataza (DH) və enoil reduktaza ardıcıl olaraq beta keto qrupunu tam doymuş karbon zəncirinə endirmək üçün işləyir.(ER).

Yağ turşusu zənciri 16 karbon uzunluğuna çatdıqda, asil daşıyıcı zülalın (ACP) fosfopantetein protez qrupu ilə kovalent bağlı olan tioesterazın (TE) təsiri ilə sərbəst buraxılır. (palmitik turşu).

Sellüloza Sintaza (UDP- əmələ gətirən)

Sellüloza istehsalına cavabdeh olan əsas ferment UDP əmələ gətirən formada sellüloza sintazadır (EC 2.4.1.12). O, ümumiyyətlə UDP-qlükoza adlanır: (1→4) Enzimologiyanın D-qlükan üçün 4-D-qlükoziltransferazası.

ÜDM-qlükoza selüloz sintaza (GDP-) adlı əlaqəli ferment tərəfindən istifadə olunur. formalaşdırılması) (AK 2.4.1.29). Həm bakteriyalar, həm də bitkilər bu fermentlər ailəsinin üzvlərinə malikdirlər.

Bakteriya üzvləri həmçinin BcsA (bakterial sellüloza sintaza) və ya CelA kimi tanınır, bitki üzvləri isə adətən CesA (selüloz sintaza) və ya spekulyativ CslA (selüloz sintaza bənzər) (sadəcə "selüloz") kimi tanınır. .

CesA bitkilər tərəfindən xloroplastın yaranmasına səbəb olan endosimbioz nəticəsində əldə edilmişdir. Qlükoziltransferazaların 2-ci ailəsinə bu (GT2) daxildir.

Yerdəki biokütlənin əksəriyyəti qlikosiltransferaza adlanan fermentlər tərəfindən biosintez və hidroliz yolu ilə istehsal olunur.

CesA super ailəsinin tərkibində məlumdur. yeddi alt ailə və birləşmiş bitki-yosun superfamiliyası 10-dan ibarətdir.

Bu fermentə malik olan yeganə heyvan qrupuurochordates, 530 milyon ildən çox əvvəl onu üfüqi gen transferi yolu ilə əldə etmişlər.

Sellüloza Sintaza (ÜDM əmələ gətirən)

Bu ferment qlikosiltransferazaların heksosiltransferaza alt ailəsinin üzvüdür. Bu ferment sinfi elmi adı ilə istinad edilir, ÜDM-qlükoza:1,4-beta-D-qlükan 4-beta-D-qlükoziltransferaza.

Tez-tez istifadə olunan digər adlar selüloz sintaza (quanozin difosfat əmələ gətirən), selüloz sintetaza və quanozin difosfoqlükoza-1,4-beta-qlükan qlükoziltransferazadır. Bu ferment saxaroza və nişasta mübadiləsində iştirak edir.

Sintetaza nədir?

Bəzən "liqaza" kimi tanınan "sintetaza" termini kimyəvi enerjiyə qənaət edən reaksiyaları kataliz edən və enerji sərf edən parçalanma hadisələri ilə məhsuldar reaksiyalar arasında vasitəçilik edən təxminən 50 fermentdən ibarət hər hansı bir sinifə aiddir. sintetik proseslər.

Enerjili fosfat bağını parçalayaraq, onlar iki molekulun birləşməsini kataliz etmək üçün lazımi enerji yaradırlar (bir çox hallarda adenozin trifosfatın [ATP] adenozin difosfata [ADP] eyni vaxtda çevrilməsi ilə) .

Amin turşusu-RNT liqazı kimi tanınan liqaza transfer RNT və amin turşusu arasında karbon-oksigen bağının yaradılmasını kataliz edən biridir.

Amid sintetaza və peptid sintetaza kimi müəyyən fermentlər aktiv olduqda, karbon-azot (C-N)bağlar əmələ gəlir.

Sintetaza həm də liqaz kimi tanınır

Sintetaza və sintaza arasındakı fərq

Sintetaza birləşməni kataliz edə bilən bir fermentdir. adətən daha böyük molekullardan birində kiçik bir asqı kimyəvi qrupunun eyni vaxtda hidrolizi ilə yeni kimyəvi bağ yaradaraq iki böyük molekul və ya iki birləşmənin birləşməsini kataliz edə bilər, məsələn, CO, C-S, C-N və s.

Liqaza adətən aşağıdakı reaksiyaya səbəb olur:

• A-C + b = Ab + C
• A+D + B + C + D + E + F = Ab + cD

Asılı, kiçik qruplaşmalar kiçik hərflərlə təmsil olunur. Liqaza replikasiya zamanı ikiqat zəncirli DNT-də yaranan tək zəncirli qırılmaları bərpa edə, həmçinin iki tamamlayıcı nuklein turşusu fraqmentini birləşdirə bilər.

Digər tərəfdən, sintaza biokimyada sintez prosesini kataliz edən fermentdir. Onlar AK nömrə təsnifatına görə liyazlar kateqoriyasına daxil edilmişdir.

Nomenklatura

Yadda saxlayın ki, bioloji nomenklatura əvvəlcə sintetaza və sintaza arasında fərq qoydu. Orijinal tərifə uyğun olaraq, sintetazlar nukleozid trifosfatlardan (ATP, GTP, CTP, TTP və UTP kimi) enerji mənbəyi kimi istifadə edir, sintazlar isə istifadə etmir.

Bununla belə, Biokimyəvi Nomenklatura üzrə Birgə Komissiyaya (JCBN) görə, "sintaza"