E.C. 6 flokkur lígasasíma inniheldur synthasa og synthetasa. Þeir taka þátt í tilbúnum efnahvörfum og hvetja sameiningu tveggja sameinda en brjóta samtímis tvífosfattenginguna í ATP eða öðru sambærilegu þrífosfati.

Öfugt við synthetasa, sem nota ATP sem orkugjafa við myndunina. af líffræðilegum efnasamböndum eru syntasar hvaða lígasar sem hvetja myndun líffræðilegra efnasambanda án þess að nota ATP sem orkugjafa.

Í þessari grein muntu kynnast nákvæmlega muninum á Synthase og Synthetase.

Hvað er Synthase?

Syntasi er ensím sem hvatar nýmyndunarferlið í lífefnafræði. Hafðu í huga að líffræðilega flokkunin gerði upphaflega greinarmun á synthetasa og synthasa.

Í samræmi við upprunalegu skilgreininguna nýta synthetasar núkleósíð þrífosföt (eins og ATP, GTP, CTP, TTP og UTP) sem orkugjafa á meðan synthasar gera það ekki.

Samt sem áður, samkvæmt Joint Commission on Biochemical Nomenclature (JCBN), er hægt að nota „synthasa“ til að vísa til hvers kyns ensíms sem hvatar nýmyndun (óháð því hvort það notar núkleósíð þrífosföt), en „syntetasa“ " ætti aðeins að nota til að vísa til "ligasa."

Hér er listi yfir dæmi um mismunandi tegundir synthasa:

• ATP synthasa
• Sítratsyntasi
• Tryptófaner hægt að nota til að vísa til hvaða ensíms sem er sem hvatar nýmyndun (óháð því hvort það notar núkleósíð þrífosföt), en „syntetasi“ ætti aðeins að nota til að vísa til „lígasa. að Synthetasi er fjölskylda ensíma sem geta myndað tengsl milli sameinda en Synthase er ensím.

  Synthasi	Synthetasi
  Hvetur tilbúið ferli án ATP	Karfst ATP
  Kemur undir vasa eða transferasa flokkun	Kemur í ligase flokkun
  t.d. HMG-COA synthasi, ATP synthasi	t.d. Succiny1-COA syntetasi, glútamín syntetasi

  Synthasa vs synthetasa samanburðartafla

  Horfðu á þetta myndband til að vita um synthasa vs synthetasa

  Ályktun

  • Synthetasar þurfa ekki NTPs til að virka þar sem þeir hvötuðu nýmyndunarferli sem kröfðust vatnsrofs á núkleósíð þrífosfötum (ekki einfaldlega ATP).
  • The International Union of Mannafnanefnd lífefnafræðinnar breytti skilgreiningu á syntasa á níunda áratugnum til að ná yfir öll tilbúin ensím, hvort sem þau notuðu NTP eða ekki, og syntetasi varð samheiti yfir lígasa.
  • Ligasi er ensím sem tengir tvær smærri sameindir saman með því að nýta orka frá NTP vatnsrofi (venjulega í gegnum þéttinguviðbrögð).
  synthasi
• Pseudouridine synthasi
• Fitusýrusyntasi
• Sellulósasyntasi (UDP-myndandi)
• Sellulósasyntasi (GDP-myndandi)

ATP synthasi

Adenósín tvífosfat (ADP) og ólífrænt fosfat eru notuð til að búa til orkugeymslusameindina adenósín þrífosfat (ATP) með próteini sem kallast ATP synthasa (Pi).

Það er flokkað sem ligasi þar sem það breytir ADP með því að mynda P-O hlekk (fosfódíestertengi). Sameindatæki sem kallast ATP synthase.

Orkulega séð er framleiðsla ATP úr ADP og Pi óæskileg og ferlið myndi venjulega fara á annan veg.

Róeinda (H+) styrkleikastigull yfir innri hvatberahimnu í heilkjörnungum eða plasmahimnu í bakteríum knýr þessi viðbrögð áfram með því að tengja ATP myndun við frumuöndun við hallann.

Í plöntum notar ATP synthasi róteinda halla sem myndast í thylakoid holrýminu yfir thylakoid himnuna og inn í blaðgrænu stroma til að framleiða ATP við ljóstillífun.

Fyrir ATPase eru heilkjörnunga ATP synthasar F -ATPasar sem virka „öfugt“. Þessa tegund er fyrst og fremst fjallað um í þessari grein. FO og F1 undireiningar F-ATPasa eru með snúningsmótor sem gerir ATP myndun kleift.

Það eru mismunandi gerðir af Synthasa

Citrate Synthase

Næstum allar lifandi frumur innihalda ensímið sítrat syntasa,sem þjónar sem gangráður í fyrsta skrefi sítrónusýruhringsins og er nefndur E.C. 2.3.3.1 (áður 4.1.3.7). (eða Krebs hringrás).

Sítratsyntasi er staðsettur í hvatberafylki heilkjörnungafrumna, þó kjarna-DNA, ekki hvatbera-DNA, kóða það.

Það er búið til í umfryminu af umfrymisríbósómum og færist síðan inn í hvatbera fylkið.

Dæmigerð megindleg ensímmerki fyrir tilvist ósnortinna hvatbera er sítratsyntasi. Hámarksvirkni sítratsyntasa sýnir hversu margir hvatberar eru til staðar í beinagrindarvöðvum.

Mikil ákafa millibilsþjálfun hefur tilhneigingu til að auka hámarksvirkni meira en annaðhvort þolþjálfun eða hástyrktar millibilsþjálfun.

Asetýlkóensím A hefur tveggja kolefna asetatleifar og sameind sem samanstendur af fjórum -kolefnisoxalóasetat þéttist og myndar sexkolefnasítrat, sem er framleitt með þéttingarhvarfi sem er hvatað af sítratsyntasa.

Tryptófansyntasi

Síðustu tvö skrefin í framleiðslu tryptófans eru hvatað af ensíminu tryptófan synthasa, einnig þekktur sem tryptófan syntetasi.

Eubacteria, Archaebacteria, Protista, Sveppir og Plantae eru tíðar hýsingar fyrir það. Hins vegar hefur Animalia það ekki. Venjulega birtist það sem 2 2 tetramer.

Undireiningarnar hvata afturkræf umbreytingu indól-3-glýserólfosfats íindól og glýseraldehýð-3-fosfat (G3P) (IGP).

Í pýridoxalfosfati (PLP) háð ferli, hvetja undireiningarnar óafturkræfa þéttingu indóls og seríns til að mynda tryptófan.

Innri vatnsfæln rás sem er 25 angström að lengd og staðsett í ensíminu tengir hvern virkan stað við aðliggjandi virka síðuna.

Þetta stuðlar að rás hvarfefnis, aðferð sem gerir indól framleitt á virkum stöðum. dreifist beint á aðra virka staði. Tryptófansyntasi inniheldur ósveipnuð virka staði.

Eubacteria, Archaebacteria, Protista, Fungi og Plantae eru oft uppgötvað að innihalda tryptófan synthasa. Það skortir menn og önnur dýr.

Ein af níu nauðsynlegum amínósýrum fyrir menn, tryptófan er ein af tuttugu stöðluðu amínósýrunum. Tryptófan er því nauðsynlegt í mataræði mannsins.

Það er líka þekkt að tryptófansyntetasi getur notað indól hliðstæður, eins og flúoruð eða metýleruð indól, sem hvarfefni til að framleiða samsvarandi tryptófan hliðstæður.

Pseudouridine

Gríski bókstafurinn psi- er notaður til að skammstafa pseudouridine, hverfa af núkleósíðinu úridíni þar sem úrasílið er tengt við kolefnisatómið með kolefnis-kolefnistengi frekar en nitur-kolefni glýkósíðtengingu. (Uracil er stundum nefnt „pseudouracil“ í þessu fyrirkomulagi.)

Algengasta RNAbreyting á frumu-RNA er pseudouridine. RNA getur gengist undir yfir 100 efnafræðilega einstakar breytingar við umritun og nýmyndun.

Auk hinna fjögurra hefðbundnu núkleótíða gætu þau hugsanlega haft áhrif á RNA tjáningu eftir umritun og haft fjölda virkni í frumunni, þar á meðal RNA þýðingu, staðsetningu og stöðugleika.

Eitt af þessu er pseudouridine, C5-glýkósíð hverfa af úridíni með C-C tengi á milli C1 í ríbósasykrinum og C5 í uracil í stað dæmigerða C1-N1 tengisins sem er til staðar í uridíni.

Það hefur frekari snúningshreyfanleika og sveigjanleika í sköpum vegna C-C tengisins. Að auki býr N1 staða pseudouridins yfir viðbótar vetnistengigjafa.

Pseudouridine, einnig kallað 5-ribosyluracil, er kunnuglegur en samt dularfullur hluti af byggingar RNA (flutningur, ríbósómal, lítill kjarna (snRNA), og lítill kjarnakjarna). Það fannst nýlega í kóða RNA líka.

Það var það fyrsta sem fannst, er það algengasta og er að finna á öllum þremur þróunarsviðum lífsins. Í ger tRNA myndar pseudouridine um 4% af núkleótíðunum

Með myndun viðbótar vetnistengja við vatn getur þessi basabreyting komið á stöðugleika í RNA og aukið basastöflun.

The fjöldi gervidúridína vex með flóknu lífveru. Það eru 11 gerviefni írRNA Escherichia coli, 30 í umfrymis rRNA ger, ein breyting á hvatbera 21S rRNA og um það bil 100 í rRNA manna.

Það hefur verið sýnt fram á að pseudouridín í rRNA og tRNA fínstillir og kemur stöðugleika á svæðisskipulagið og hjálpar til við að viðhalda hlutverkum þeirra við afkóðun mRNA, samsetningu ríbósóma, vinnslu og þýðingar.

Það hefur verið sýnt fram á að pseudouridine í snRNA bætir tengslin milli pre-mRNA og spliceosomal RNA til að hjálpa til við að stjórna splicing.

Fatty Acid Synthase

The FASN gen í mönnum kóðar fyrir ensímið sem kallast fitusýrusyntasi (FAS). Fjöl-ensím prótein sem kallast fitusýrusyntasi hvatar myndun fitusýra.

Þetta er heilt ensímkerfi, ekki bara eitt ensím, sem samanstendur af tveimur eins 272 kDa fjölvirkum fjölpeptíðum sem flytja hvarfefni frá einu starfhæfu léni til þess næsta.

Aðalverk þess er að nota NADPH til að hvetja myndun palmitats (C16:0, langkeðju mettuð fitusýra) úr asetýl- og malónýl-CoA

asetýl-CoA og malónýl -CoA er breytt í fitusýrur með röð af karboxýlerandi Claisen þéttingarferlum.

Eftir hverja lengingarlotu vinna ketóredúktasi (KR), dehýdratasi (DH) og enóýlredúktasi í röð til að minnka beta ketóhópinn í fullkomlega mettaða kolefniskeðjuna(ER).

Þegar fitusýrukeðjan hefur stækkað í 16 kolefnislengd losnar hún með verkun þíóesterasa (TE), sem er samgilt tengdur fosfópanteþín gervihópi asýlburðarpróteins (ACP) (palmitínsýra).

Sellulósasyntasi (UDP-myndandi)

Aðal ensímið sem ber ábyrgð á framleiðslu sellulósa er sellulósasyntasi (EC 2.4.1.12) í UDP-myndandi formi. Það er almennt nefnt UDP-glúkósa: (1→4) 4-D-glúkósýltransferasi ensímfræði fyrir D-glúkan.

GDP-glúkósa er notað af skyldu ensími sem kallast sellulósasyntasi (GDP- mynda) (EC 2.4.1.29). Bæði bakteríur og plöntur hafa meðlimi þessarar ensímafjölskyldu.

Bakteríumeðlimir geta einnig verið þekktir sem BcsA (sellulósasyntasi) eða CelA, en plöntumeðlimir eru venjulega þekktir sem CesA (sellulósasyntasi) eða íhugandi CslA (sellulósasyntasalíkur) (einfaldlega „sellulósa“) .

CesA var aflað af plöntum vegna endósamlífis sem olli grænukorninu. Fjölskylda 2 af glúkósýltransferasa inniheldur þennan (GT2).

Meirihluti lífmassans á jörðinni er framleiddur með nýmyndun og vatnsrof af ensímum sem kallast glýkósýltransferasar.

Vitað er að plöntu CesA yfirfjölskyldan inniheldur sjö undirættkvíslir, og sameinuð plöntu-þörunga yfirfjölskylda inniheldur 10.

Ei dýrahópurinn sem býr yfir þessu ensími erurochordates, sem fengu það með láréttum genaflutningi fyrir meira en 530 milljónum ára.

Selluósasyntasi (GDP-myndandi)

Þetta ensím er meðlimur í hexosýltransferasa undirfjölskyldu glýkósýltransferasa. Þessi ensímflokkur er nefndur með fræðiheiti sínu, GDP-glúkósa:1,4-beta-D-glúkan 4-beta-D-glúkósýltransferasa.

Önnur nöfn sem eru oft notuð eru sellulósasyntasi (gúanósín tvífosfatmyndandi), sellulósasyntetasi og gúanósín tvífosfóglúkósi-1,4-beta-glúkan glúkósýltransferasi. Þetta ensím tekur þátt í umbrotum súkrósa og sterkju.

Hvað er syntetasi?

Hugtakið „syntetasi,“ stundum þekkt sem „lígasi“, vísar til hvers kyns af flokki um það bil 50 ensíma sem hvetur efnafræðilega orkusparandi viðbrögð og miðlar á milli orkufreðra niðurbrotsatburða og framleiðslu. gerviferli.

Með því að kljúfa öflugt fosfattengi mynda þau nauðsynlega orku til að hvetja sameiningu tveggja sameinda (í mörgum tilfellum með samtímis umbreytingu adenósín þrífosfats [ATP] í adenósín tvífosfat [ADP]) .

Lígasi þekktur sem amínósýru-RNA ligasi er sá sem hvetur myndun kolefnis-súrefnistengis milli flutnings-RNA og amínósýru.

Þegar tiltekin ensím, eins og amíðsyntetasar og peptíðsynthetasar, eru virk, kolefni-nitur (C-N)tengi myndast.

Syntetasi er einnig þekktur sem Ligasi

Mismunur á Synthetasa og Synthasa

Syntetasi er ensím sem getur hvatt tengingu tvær stórar sameindir með því að búa til nýtt efnatengi, venjulega með samtímis vatnsrofi á litlum pendant efnahópi á einni af stærri sameindunum, eða það getur hvatt tengingu tveggja efnasambanda, svo sem tengingu C-O, C-S, C-N, osfrv.

Lígasi veldur venjulega eftirfarandi viðbrögðum:

• A-C + b = Ab + C
• A+D + B + C + D + E + F = Ab + cD

Þar sem hinir háðu, örsmáu hópar eru táknaðir með lágstöfum. Ligasi getur lagað einþátta brot sem myndast í tvíþátta DNA við eftirmyndun auk þess að tengja saman tvö samsett kjarnsýrubrot.

Aftur á móti er syntasi ensím sem hvatar nýmyndunarferlið í lífefnafræði. Þau eru innifalin í flokki lýasa samkvæmt EB-númeraflokkuninni.

Nafnakerfi

Hafðu í huga að líffræðilega flokkunin gerði upphaflega greinarmun á synthetasa og synthasa. Í samræmi við upprunalegu skilgreininguna nota synthetasar núkleósíð þrífosföt (eins og ATP, GTP, CTP, TTP og UTP) sem orkugjafa á meðan synthasar gera það ekki.

Engu að síður, samkvæmt sameiginlegu nefndinni um lífefnafræði (JCBN), „syntasi“