Е.Ц. 6 класа ензима лигазе укључује синтазе и синтетазе. Они учествују у синтетичким реакцијама и катализују комбиновање два молекула док истовремено разбијају дифосфатну везу у АТП-у или другом упоредивом трифосфату.

За разлику од синтетаза, које користе АТП као извор енергије током синтезе од биолошких једињења, синтазе су све лигазе које катализују синтезу биолошких једињења без употребе АТП-а као извора енергије.

У овом чланку ћете сазнати тачно разлику између синтазе и синтетазе.

Шта је Синтаза?

Синтаза је ензим који катализује процес синтезе у биохемији. Имајте на уму да је биолошка номенклатура у почетку разликовала синтетазе и синтазе.

У складу са оригиналном дефиницијом, синтетазе користе нуклеозид трифосфате (као што су АТП, ГТП, ЦТП, ТТП и УТП) као извор енергије, док синтетазе не користе.

Ипак, према Заједничкој комисији за биохемијску номенклатуру (ЈЦБН), „синтаза“ се може користити за означавање било којег ензима који катализује синтезу (без обзира да ли користи нуклеозид трифосфате), али „синтетаза ” треба користити само за означавање „лигазе“.

Овде је листа примера различитих типова синтазе:

• АТП синтаза
• Цитрат синтаза
• Триптофанможе се користити за означавање било којег ензима који катализује синтезу (без обзира да ли користи нуклеозид трифосфате), али „синтетаза“ треба да се користи само за означавање „лигазе“.

  Примарна разлика између синтазе и синтетазе је да је синтетаза породица ензима који могу да стварају везе између молекула, док је синтетаза ензим.

  Синтаза	Синтетаза
  Катализује синтетички процес без АТП	Захтева АТП
  Долази под класификацију вазе или трансферазе	Долази под класификацију лигазе
  нпр. ХМГ-ЦОА синтаза, АТП синтаза	нпр. Суццини1-ЦОА синтетаза, глутамин синтетаза

  Синтхасе вс Синтхетасе Табела поређења

  Погледајте овај видео да бисте сазнали више о синтази против синтетазе

  Закључак

  • Синтетазе не требају НТП да би функционисале јер су катализирале синтетичке процесе који су захтијевали хидролизу нуклеозид трифосфата (не само АТП).
  • Међународна унија Биохемијски комитет за номенклатуру променио је дефиницију синтазе 1980-их да обухвати све синтетичке ензиме, без обзира да ли су користили НТП или не, а синтетаза је постала синоним за лигазу.
  • Лигаза је ензим који спаја два мања молекула користећи енергија из НТП хидролизе (обично кроз кондензацијуреакција).
  синтаза
• Псеудоуридин синтаза
• Синтаза масних киселина
• Целулозна синтаза (формира УДП)
• Целулозна синтаза (формира ГДП)

АТП синтаза

Аденозин дифосфат (АДП) и неоргански фосфат се користе за стварање молекула за складиштење енергије аденозин трифосфата (АТП) помоћу протеина који се зове АТП синтаза (Пи).

Категорисан је као лигаза јер модификује АДП формирањем П-О везе (фосфодиестарска веза). Молекуларни уређај који се зове АТП синтаза.

У енергетском смислу, производња АТП-а из АДП-а и Пи је непожељна, а процес би обично ишао другим путем.

Градијент концентрације протона (Х+) преко унутрашње митохондријалне мембране код еукариота или плазма мембране код бактерија покреће ову реакцију унапред спајањем синтезе АТП-а током ћелијског дисања са градијентом.

У биљкама, АТП синтаза користи протонски градијент формиран у тилакоидном лумену преко тилакоидне мембране и у строму хлоропласта да би произвела АТП током фотосинтезе.

За АТПазу, еукариотске АТП синтазе су Ф -АТПазе које функционишу „обрнуто“. О овој врсти се првенствено говори у овом чланку. ФО и Ф1 подјединице Ф-АТПазе имају ротациони моторни механизам који омогућава синтезу АТП-а.

Постоје различити типови синтазе

цитрат синтазе

Скоро све живе ћелије садрже ензим цитрат синтазу,који служи као пејсмејкер у првом кораку циклуса лимунске киселине и означен је као Е.Ц. 2.3.3.1 (раније 4.1.3.7). (или Кребсов циклус).

Цитат синтаза се налази у митохондријском матриксу еукариотских ћелија, иако је кодира нуклеарна ДНК, а не митохондријска ДНК.

У цитоплазми га стварају цитоплазматски рибозоми и затим се премешта у матрикс митохондрија.

Типичан квантитативни маркер ензима за постојање интактних митохондрија је цитрат синтаза. Максимална активност цитрат синтазе открива колико је митохондрија присутно у скелетним мишићима.

Интервални тренинг високог интензитета има потенцијал да повећа максималну активност више од тренинга издржљивости или интервалног тренинга високог интензитета.

Ацетил коензим А има остатак од два угљеника ацетата и молекул од четири -угљен-оксалоацетат се кондензује да би се добио цитрат са шест угљеника, који се производи реакцијом кондензације катализованом цитрат синтазом.

Триптофан синтаза

Последња два корака у производњи триптофана су катализован ензимом триптофан синтетаза, такође позната као триптофан синтетаза.

Еубацтериа, Арцхаебацтериа, Протиста, Фунги и Плантае су му чести домаћини. Међутим, Анималиа га нема. Обично се појављује као 2 2 тетрамер.

Подјединице катализују реверзибилну конверзију индол-3-глицерол фосфата уиндол и глицералдехид-3-фосфат (Г3П) (ИГП).

У процесу који зависи од пиридоксал фосфата (ПЛП), подјединице катализују иреверзибилну кондензацију индола и серина да би се генерисао триптофан.

Унутрашњи хидрофобни канал који је дугачак 25 ангстрома и смештен у ензиму повезује свако активно место са суседним активним местом.

Ово промовише каналисање супстрата, механизам којим се индол производи на активним местима дифундује директно на друга активна места. Триптофан синтаза садржи алостерички спојена активна места.

Еубацтериа, Арцхаебацтериа, Протиста, Фунги и Плантае често укључују триптофан синтазу. Људима и другим животињама то недостаје.

Једна од девет неопходних амино киселина за људе, триптофан је једна од двадесет стандардних амино киселина. Триптофан је стога неопходан за људску исхрану.

Такође је познато да триптофан синтетаза може да користи аналоге индола, као што су флуоровани или метиловани индоли, као супстрате за производњу еквивалентних аналога триптофана.

Псеудоуридин

Грчко слово пси- користи се за скраћење псеудоуридина, изомера нуклеозида уридина у коме је урацил повезан са атомом угљеника везом угљеник-угљеник, а не гликозидном везом азот-угљеник. (Урацил се повремено назива „псеудоурацил“ у овом аранжману.)

Најчешћа РНКпромена у ћелијској РНК је псеудоуридин. РНК може да претрпи преко 100 хемијски јединствених промена током транскрипције и синтезе.

Поред четири конвенционална нуклеотида, они потенцијално могу утицати на експресију РНК након транскрипције и имају бројне функције у ћелији, укључујући транслацију РНК, локализацију и стабилност.

Један од њих је псеудоуридин, Ц5-гликозидни изомер уридина са Ц-Ц везом између Ц1 шећера рибозе и Ц5 урацила уместо типичне Ц1-Н1 везе присутне у уридину.

Има додатну покретљивост ротације и конформациону флексибилност због Ц-Ц везе. Поред тога, Н1 позиција псеудоуридина поседује додатног донора водоничне везе.

Псеудоуридин, такође назван 5-рибозилурацил, је позната, али мистериозна компонента структурних РНК (трансфер, рибосомална, мала нуклеарна (снРНА) и мали нуклеолар). Недавно је пронађен и у кодирању РНК.

Био је први откривен, најраспрострањенији је и може се наћи у сва три еволуциона домена живота. У тРНК квасца, псеудоуридин чини око 4% нуклеотида

Кроз формирање додатних водоничних веза са водом, ова промена базе је у стању да стабилизује РНК и побољша слагање база.

број псеудоуридина расте са сложеношћу организма. Постоји 11 псеудоуридинарРНК Есцхерицхиа цоли, 30 у цитоплазматској рРНК квасца, једна промена у митохондријалној 21С рРНК, и отприлике 100 у рРНК људи.

Показано је да псеудоуридин у рРНК и тРНК фино подешене и стабилизује регионалну структуру и помаже у одржавању њихове улоге у декодирању иРНК, састављању рибозома, обради и транслацији.

Показано је да псеудоуридин у снРНА побољшава интерфејс између пре-мРНК и сплицеосомалне РНК како би помогао у регулисању спајања.

Синтаза масних киселина

ФАСН ген код људи кодира ензим познат као синтаза масних киселина (ФАС). Вишеензимски протеин назван синтаза масних киселина катализује синтезу масних киселина.

То је читав ензимски систем, а не само један ензим, састављен од два идентична мултифункционална полипептида од 272 кДа који преносе супстрате са једног функционалног домена на други.

Његов примарни посао је да користи НАДПХ да катализира стварање палмитата (Ц16:0, дуголанчане засићене масне киселине) из ацетил- и малонил-ЦоА

ацетил-ЦоА и малонила -ЦоА се претварају у масне киселине низом декарбоксилативних Цлаисен кондензационих процеса.

После сваког круга елонгације, кеторедуктаза (КР), дехидратаза (ДХ) и еноил редуктаза раде у низу како би смањили бета кето групу до потпуно засићеног угљеничног ланца(ЕР).

Када ланац масних киселина нарасте до дужине од 16 угљеника, ослобађа се дејством тиоестеразе (ТЕ), која је ковалентно повезана са фосфопантетеин протетичком групом протеина носача ацил (АЦП) (палмитинска киселина).

Синтаза целулозе (УДП-формирање)

Примарни ензим одговоран за производњу целулозе је целулозна синтаза (ЕЦ 2.4.1.12) у свом облику који формира УДП. Уопштено се назива УДП-глукоза: (1→4) Ензимолошка 4-Д-глукозилтрансфераза за Д-глукан.

ГДП-глукоза користи сродни ензим који се зове целулозна синтаза (ГДП- формирање) (ЕЦ 2.4.1.29). И бактерије и биљке имају чланове ове породице ензима.

Чланови бактерије могу бити познати и као БцсА (бактеријска целулозна синтаза) или ЦелА, док су чланови биљке обично познати као ЦесА (целулозна синтаза) или спекулативни ЦслА (слично целулозној синтази) (једноставно „целулоза“) .

ЦесА су биљке добиле као резултат ендосимбиозе која је довела до хлоропласта. Фамилија 2 глукозилтрансфераза укључује ову (ГТ2).

Већина биомасе на Земљи се производи биосинтезом и хидролизом помоћу ензима који се зову гликозилтрансферазе.

Познато је да суперфамилија биљака ЦесА садржи седам потфамилија, а комбинована суперфамилија биљака и алги садржи 10.

Једина група животиња која поседује овај ензим јеурохордати, који су га добили хоризонталним трансфером гена пре више од 530 милиона година.

Синтаза целулозе (ГДП-формирање)

Овај ензим је члан подфамилије хексозилтрансфераза гликозилтрансфераза. Ова класа ензима се назива својим научним именом, ГДП-глукоза:1,4-бета-Д-глукан 4-бета-Д-глукозилтрансфераза.

Други називи који се често користе су целулозна синтаза (која формира гванозин дифосфат), целулозна синтетаза и гванозин дифосфоглукоза-1,4-бета-глукан глукозилтрансфераза. Овај ензим учествује у метаболизму сахарозе и скроба.

Шта је синтетаза?

Израз „синтетаза“, понекад познат као „лигаза“, односи се на било који од око 50 ензима који катализују хемијске реакције које штеде енергију и посредује између догађаја распада који троше енергију и продуктивних синтетички процеси.

Цепањем енергетске фосфатне везе, они стварају неопходну енергију за катализацију комбиновања два молекула (у многим случајевима, истовременом конверзијом аденозин трифосфата [АТП] у аденозин дифосфат [АДП]) .

Лигаза позната као аминокиселина-РНА лигаза је она која катализује стварање везе угљеник-кисеоник између трансферне РНК и аминокиселине.

Када су одређени ензими, као што су амид синтетазе и пептидне синтетазе, активни, угљеник-азот (Ц-Н)настају везе.

Синтетаза је такође позната као лигаза

Разлика између синтетазе и синтазе

Синтетаза је ензим који може да катализира спајање два велика молекула стварањем нове хемијске везе, обично уз истовремену хидролизу мале привеске хемијске групе на једном од већих молекула, или може катализирати повезивање два једињења, као што је спајање Ц-О, Ц-С, Ц-Н, итд. .

Лигаза обично изазива следећу реакцију:

• А-Ц + б = Аб + Ц
• А+Д + Б + Ц + Д + Е + Ф = Аб + цД

Где су зависне, мале групе представљене малим словима. Лигаза може да поправи једноланчане прекиде који се развијају у дволанчаној ДНК током репликације, као и да повеже два комплементарна фрагмента нуклеинске киселине.

С друге стране, синтаза је ензим који катализује процес синтезе у биохемији. Уврштени су у категорију лиаза према категоризацији ЕЦ броја.

Номенклатура

Имајте на уму да је биолошка номенклатура у почетку разликовала синтетазе и синтетазе. У складу са првобитном дефиницијом, синтетазе користе нуклеозид трифосфате (као што су АТП, ГТП, ЦТП, ТТП и УТП) као извор енергије, док синтетазе не.

Ипак, према Заједничкој комисији за биохемијску номенклатуру (ЈЦБН), „синтаза“