Mae dosbarth E.C. 6 o ensymau ligas yn cynnwys synthases a synthetasau. Maent yn cymryd rhan mewn adweithiau synthetig ac yn cataleiddio cyfuno dau foleciwl tra ar yr un pryd yn torri'r cyswllt deuffosffad mewn ATP neu driffosffad tebyg arall.

Yn wahanol i synthetasau, sy'n defnyddio ATP fel ffynhonnell egni yn ystod y synthesis o gyfansoddion biolegol, synthases yw unrhyw ligasau sy'n cataleiddio synthesis cyfansoddion biolegol heb ddefnyddio ATP fel ffynhonnell egni.

Yn yr erthygl hon, byddwch yn dod i wybod yn union y gwahaniaeth rhwng Synthase a Synthetase.

Beth Yw Synthase?

Ensym yw synthase sy'n cataleiddio'r broses synthesis mewn biocemeg. Cofiwch fod yr enwau biolegol i ddechrau yn gwahaniaethu rhwng synthetasau a synthases.

Yn unol â'r diffiniad gwreiddiol, mae synthetasau'n defnyddio triffosffadau niwcleosid (fel ATP, GTP, CTP, TTP, ac UTP) fel ffynhonnell egni tra nad yw synthases yn gwneud hynny.

Serch hynny, yn ôl y Cyd-Gomisiwn ar Enwau Biocemegol (JCBN), gellir defnyddio “synthase” i gyfeirio at unrhyw ensym sy’n cataleiddio synthesis (ni waeth a yw’n defnyddio niwcleosid triffosffad), ond “synthetas ” dim ond i gyfeirio at “ligase.”

Dyma restr o enghreifftiau o wahanol fathau o synthase:

• ATP synthase
• Citrad synthase
• Tryptophangellir ei ddefnyddio i gyfeirio at unrhyw ensym sy'n cataleiddio synthesis (ni waeth a yw'n defnyddio niwcleosid triffosffadau), ond dylid defnyddio “synthetase” i gyfeirio at “ligase” yn unig.

  Y prif wahaniaeth rhwng Synthase a Synthetase yw bod Synthetase yn deulu o ensymau a all gynhyrchu bondiau rhwng moleciwlau, tra bod Synthase yn ensym.

  Cataleiddio proses synthetig heb ATP

  Synthase	Synthetase
  Angen ATP
  Yn dod o dan ddosbarthiad ffiol neu drosglwyddiad	Yn dod o dan ddosbarthiad ligas
  e.e. synthase HMG-COA, ATP synthase	e.e. Synthetase Succiny1-COA, Glutamine synthetase

  Tabl Cymharu Synthase vs Synthetase

  Gwyliwch y Fideo Hwn I Wybod Am Synthase vs Synthetase <3

  Casgliad

  • Nid oes angen NTPs ar synthetasau i weithredu gan eu bod wedi cataleiddio prosesau synthetig a oedd angen hydrolysis triffosffadau niwcleosid (nid ATP yn unig).
  • Undeb Rhyngwladol y Newidiodd Pwyllgor Enwebu Biocemeg y diffiniad o synthase yn y 1980au i gwmpasu'r holl ensymau synthetig, p'un a oeddent yn defnyddio NTPs ai peidio, a daeth synthetase yn gyfystyr â ligas.
  • Mae ligase yn ensym sy'n uno dau foleciwl llai â'i gilydd trwy ddefnyddio'r egni o hydrolysis NTP (trwy gyddwysiad fel arferadwaith).
  synthase
• Pseudouridine synthase
• Synthase asid brasterog
• Synthase cellwlos (ffurfio CDU)
• Synthase cellwlos (ffurfio CMC)

ATP Synthase

Defnyddir adenosine diphosphate (ADP) a ffosffad anorganig i greu'r moleciwl storio ynni adenosine triphosphate (ATP) gan brotein o'r enw ATP synthase (Pi).

Mae wedi'i gategoreiddio fel ligas gan ei fod yn addasu ADP trwy ffurfio cyswllt P-O (bond ffosffodiester). Dyfais foleciwlaidd o'r enw ATP synthase.

Ynni ynni, mae cynhyrchu ATP o ADP a Pi yn annymunol, a byddai'r broses fel arfer yn mynd y ffordd arall.

Mae graddiant crynodiad proton (H+) ar draws y bilen mitocondriaidd fewnol mewn ewcaryotau neu'r bilen plasma mewn bacteria yn gyrru'r adwaith hwn ymlaen trwy gyplu synthesis ATP yn ystod resbiradaeth cellog i'r graddiant.

Mewn planhigion, mae ATP synthase yn defnyddio graddiant proton a ffurfiwyd yn y lwmen thylacoid ar draws y bilen thylacoid ac i mewn i'r stroma cloroplast i gynhyrchu ATP yn ystod ffotosynthesis.

Ar gyfer ATPase, synthases ATP ewcaryotig yw F -ATPases sy'n gweithredu "yn y cefn." Mae'r math hwn yn cael ei drafod yn bennaf yn yr erthygl hon. Mae gan is-unedau FO ac F1 F-ATPase fecanwaith modur cylchdro sy'n galluogi synthesis ATP.

Mae yna wahanol fathau o Synthase

Citrate Synthase

1> Mae bron pob cell byw yn cynnwys yr ensym citrate synthase,sy'n gweithredu fel rheolydd calon yng ngham cyntaf y gylchred asid sitrig ac sydd wedi'i ddynodi'n E.C. 2.3.3.1 (4.1.3.7 yn flaenorol). (neu gylchred Krebs).

Mae citrate synthase wedi'i leoli ym matrics mitocondriaidd celloedd ewcaryotig, er bod DNA niwclear, nid DNA mitocondriaidd, yn ei amgodio.

Mae'n cael ei greu yn y cytoplasm gan ribosomau sytoplasmig ac yna'n cael ei symud i'r matrics mitocondriaidd.

Marc ensymau meintiol nodweddiadol ar gyfer bodolaeth mitocondria cyfan yw citrate synthase. Mae gweithgaredd brig citrate synthase yn datgelu faint o mitocondria sy'n bresennol mewn cyhyrau ysgerbydol.

Mae gan hyfforddiant ysbeidiol dwysedd uchel y potensial i gynyddu gweithgaredd mwyaf na naill ai hyfforddiant dygnwch neu hyfforddiant cyfwng dwysedd uchel.

Mae gan asetyl coenzyme A weddillion asetad dau garbon a moleciwl o bedwar -mae ocsaloasetad carbon yn cyddwyso i gynhyrchu sitrad chwe-charbon, sy'n cael ei gynhyrchu gan yr adwaith cyddwyso sy'n cael ei gataleiddio gan citrate synthase.

Tryptoffan Synthase

Y ddau gam olaf wrth gynhyrchu tryptoffan yw wedi'i gataleiddio gan yr ensym tryptoffan synthase, a elwir hefyd yn synthetase tryptoffan.

Mae Eubacteria, Archaebacteria, Protista, Fungi, a Plantae yn lletya'n aml iddo. Fodd bynnag, nid yw gan Animalia. Fel arfer, mae'n ymddangos fel tetramer 2 2.

Mae'r is-unedau yn cataleiddio trosiad cildroadwy o ffosffad indole-3-glyserol iindole a glyseraldehyde-3-ffosffad (G3P) (IGP).

Mewn proses sy'n dibynnu ar ffosffad pyridoxal (PLP), mae'r is-unedau yn cataleiddio cyddwysiad anwrthdroadwy indole a serine i gynhyrchu tryptoffan.

Mae sianel hydroffobig fewnol sy'n 25 angstroms o hyd ac sydd wedi'i lleoli yn yr ensym yn cysylltu pob safle actif â'r safle gweithredol cyfagos.

Mae hyn yn hybu sianelu swbstrad, sef mecanwaith sy'n cynhyrchu indole mewn safleoedd gweithredol yn tryledu yn uniongyrchol i safleoedd gweithredol eraill. Mae tryptoffan synthase yn cynnwys safleoedd actif sydd wedi'u cyplysu'n aloterig.

Darganfyddir yn aml eu bod yn cynnwys tryptoffan synthase Eubacteria, Archaebacteria, Protista, Fungi, a Plantae. Mae bodau dynol ac anifeiliaid eraill yn brin ohono.

Un o'r naw asid amino angenrheidiol ar gyfer bodau dynol, tryptoffan yw un o'r ugain asid amino safonol. Mae tryptoffan felly yn hanfodol i'r diet dynol.

Mae'n hysbys hefyd y gall tryptoffan synthetase ddefnyddio analogau indole, megis mewndolau fflworinedig neu fethyledig, fel swbstradau i gynhyrchu'r analogau tryptoffan cyfatebol.

Pseudouridine

Defnyddir y llythyren Roegaidd psi- i dalfyrru pseudouridine, isomer o’r wridin niwcleosid lle mae’r uracil wedi’i gysylltu â’r atom carbon gan gyswllt carbon-carbon yn hytrach na chysylltiad glycosidig nitrogen-carbon. (Cyfeirir at Uracil yn achlysurol fel “pseudouracil” yn y trefniant hwn.)

Yr RNA mwyaf cyffredinMae newid mewn RNA cellog yn ffugenwidin. Gall RNA gael dros 100 o newidiadau cemegol unigryw yn ystod trawsgrifio a synthesis.

Yn ogystal â'r pedwar niwcleotidau confensiynol, mae'n bosibl y gallai'r rhain effeithio ar fynegiant RNA yn ôl-drawsysgrifol a bod â nifer o swyddogaethau yn y gell, gan gynnwys cyfieithu RNA, lleoleiddio, a sefydlogrwydd.

Un o'r rhain yw ffugwridin, isomer C5-glycoside o wridin gyda bond C-C rhwng C1 y siwgr ribos a C5 uracil yn lle'r bond C1-N1 nodweddiadol sy'n bresennol mewn wridin.

Mae ganddo symudedd cylchdro ychwanegol a hyblygrwydd cydffurfiad oherwydd y bond C-C. Yn ogystal, mae safle N1 pseudouridine yn meddu ar roddwr bond hydrogen ychwanegol.

Mae pseudouridine, a elwir hefyd yn 5-ribosyluracil, yn elfen gyfarwydd ond dirgel o RNAs strwythurol (trosglwyddo, ribosomaidd, niwclear bach (snRNA), a niwclear bach). Fe'i canfuwyd yn ddiweddar mewn codio RNA hefyd.

Hwn oedd y cyntaf i gael ei ganfod, dyma'r mwyaf cyffredin, ac mae i'w gael ym mhob un o'r tri pharth esblygiadol o fywyd. Yn y tRNA burum, mae pseudouridine yn gwneud tua 4% o'r niwcleotidau

Drwy ffurfio bondiau hydrogen ychwanegol â dŵr, mae'r newid sylfaen hwn yn gallu sefydlogi RNA a gwella pentyrru bas.

Y mae nifer y pseudouridinau yn tyfu gyda chymhlethdod organeb. Mae yna 11 pseudouridines ynrRNA Escherichia coli, 30 yn rRNA cytoplasmig burum, un newid yn yr rRNA 21S mitocondriaidd, a thua 100 yn rRNA bodau dynol. ac yn sefydlogi'r strwythur rhanbarthol ac yn cynorthwyo i gynnal eu rolau mewn datgodio mRNA, cydosod ribosom, prosesu, a chyfieithu.

Dangoswyd bod ffug-oridin mewn snRNA yn gwella'r rhyngwyneb rhwng cyn-mRNA a'r RNA spliceosomal i helpu i reoleiddio splicing.

Fatty Asid Synthase

Y FASN mae genyn mewn bodau dynol yn amgodio'r ensym a elwir yn asid brasterog synthase (FAS). Mae protein aml-ensym o'r enw asid brasterog synthase yn cataleiddio synthesis asidau brasterog.

Mae'n system ensymatig gyfan, nid dim ond un ensym, sy'n cynnwys dau polypeptid amlswyddogaethol 272 kDa union yr un fath sy'n trosglwyddo swbstradau o un parth swyddogaethol i'r nesaf.

Ei brif waith yw defnyddio NADPH i gataleiddio creu palmitate (C16:0, asid brasterog dirlawn cadwyn hir) o asetyl- a malonyl-CoA

Asetyl-CoA a malonyl -CoA yn cael eu trawsnewid yn asidau brasterog trwy ddilyniant o brosesau anwedd Claisen decarboxylative.

Yn dilyn pob rownd o elongation, mae ketoreductase (KR), dehydratase (DH), ac enoyl reductase yn gweithio mewn dilyniant i leihau'r grŵp beta ceto i'r gadwyn garbon gwbl dirlawn(ER).

Pan fydd y gadwyn asid brasterog wedi tyfu i hyd o 16 carbon, caiff ei ryddhau gan weithred thioesterase (TE), sydd wedi'i gysylltu'n cofalent â grŵp prosthetig ffosffopantetheine o brotein cludo acyl (ACP) (asid palmtig).

Synthase Cellwlos (Ffurfio CDU)

Y prif ensym sy'n gyfrifol am gynhyrchu seliwlos yw cellwlos synthase (EC 2.4.1.12) yn ei ffurf ffurfio CDU. Cyfeirir ato'n gyffredinol fel CDU-glwcos: (1→4) 4-D-glucosyltransferase Enzymology ar gyfer D-glwcan.

Defnyddir CMC-glwcos gan ensym cysylltiedig o'r enw cellwlos synthase (GDP- ffurfio) (EC 2.4.1.29). Mae gan facteria a phlanhigion aelodau o'r teulu hwn o ensymau.

Gall aelodau bacteriol gael eu galw hefyd yn BcsA (synthase cellwlos bacteriol) neu CelA, tra bod aelodau planhigion fel arfer yn cael eu hadnabod fel CesA (synthase cellwlos) neu’r CSLA hapfasnachol (tebyg i seliwlos synthase) (yn syml “cellwlos”) .

Cafodd CesA ei gaffael gan blanhigion o ganlyniad i’r endosymbiosis a arweiniodd at y cloroplast. Mae teulu 2 o'r glucosyltransferases yn cynnwys yr un hwn (GT2).

Cynhyrchir y rhan fwyaf o'r biomas ar y Ddaear trwy fiosynthesis a hydrolysis gan ensymau o'r enw glycosyltransferases.

Mae'n hysbys bod y planhigyn CesA superfamily yn cynnwys saith is-deulu, ac mae'r superfamily planhigion-algaidd cyfun yn cynnwys 10.

Yr unig grŵp o anifeiliaid sy'n meddu ar yr ensym hwn yw'rurocordates, a gafodd trwy drosglwyddiad genynnau llorweddol fwy na 530 miliwn o flynyddoedd yn ôl.

Cellwlos Synthase (Ffurfio CMC)

Mae'r ensym hwn yn aelod o'r is-deulu hecsosyltransferase o glycosyltransferases. Cyfeirir at y dosbarth ensym hwn gan ei enw gwyddonol, GDP-glwcos: 1,4-beta-D-glwcan 4-beta-D-glucosyltransferase.

Enwau eraill sy'n cael eu defnyddio'n aml yw cellwlos synthase (ffurfio gwanosin diffosffad), synthetase seliwlos, a guanosin diphosphoglucose-1,4-beta-glucan glucosyltransferase. Mae'r ensym hwn yn cymryd rhan ym metabolaeth swcros a startsh.

Beth Yw Synthetase?

Mae’r term “synthetase,” a elwir weithiau yn “ligase,” yn cyfeirio at unrhyw un o ddosbarth o tua 50 o ensymau sy’n cataleiddio adweithiau cemegol sy’n arbed ynni ac yn cyfryngu rhwng digwyddiadau chwalu sy’n defnyddio ynni a chynhyrchiol. prosesau synthetig.

Trwy hollti bond ffosffad egnïol, maent yn cynhyrchu'r egni angenrheidiol i gataleiddio cyfuno dau foleciwl (mewn llawer o achosion, trwy drosi adenosine triphosphate [ATP] i adenosine diphosphate [ADP] ar yr un pryd) .

Ligas a elwir yn asid amino-RNA ligas yw un sy'n cataleiddio creu bond carbon-ocsigen rhwng RNA trosglwyddo ac asid amino.

Pan fo ensymau penodol, fel synthetasau amid, a synthetasau peptid, yn actif, mae carbon-nitrogen (C-N)bondiau'n cael eu cynhyrchu.

Mae synthetase hefyd yn cael ei adnabod fel Ligas

Gwahaniaeth rhwng Synthetas a Synthase

Ensym yw synthetas sy'n gallu cataleiddio uniad dau foleciwl mawr trwy greu bond cemegol newydd, yn nodweddiadol gyda hydrolysis cydamserol grŵp cemegol crog bach ar un o'r moleciwlau mwy, neu gall gataleiddio cysylltu dau gyfansoddyn, megis uno C-O, C-S, C-N, ac ati

Mae ligas fel arfer yn achosi'r adwaith canlynol i ddigwydd:

• A-C + b = Ab + C
• A+D + B + C + D + E + F = Ab + cD

Lle mae'r grwpiau dibynnol, bach yn cael eu cynrychioli gan lythrennau bach. Gall Ligase atgyweirio toriadau un llinyn sy'n datblygu mewn DNA llinyn dwbl wrth atgynhyrchu yn ogystal â chysylltu dau ddarn o asid niwclëig cyflenwol.

Ar y llaw arall, mae synthase yn ensym sy'n cataleiddio'r broses synthesis mewn biocemeg. Maent wedi'u cynnwys yn y categori lyasau yn ôl categori rhif y CE.

Enwebiad

Cofiwch fod yr enwau biolegol i ddechrau yn gwahaniaethu rhwng synthetasau a synthases. Yn unol â'r diffiniad gwreiddiol, mae synthetasau yn defnyddio triffosffadau niwcleosid (fel ATP, GTP, CTP, TTP, ac UTP) fel ffynhonnell egni tra nad yw synthases yn gwneud hynny.

Serch hynny, yn ôl y Cyd-Gomisiwn ar Enwau Biocemegol (JCBN), “synthase”