E.C. 6 ligasa entzimen klaseak sintasak eta sintetasak biltzen ditu. Erreakzio sintetikoetan parte hartzen dute eta bi molekularen konbinazioa katalizatzen dute, aldi berean, ATPan edo beste trifosfato konparagarri batean difosfato-lotura hausten duten bitartean.

Sintetasen aldean, ATP energia iturri gisa erabiltzen baitute sintesian. konposatu biologikoen sintasak ATP energia-iturri gisa erabili gabe konposatu biologikoen sintesia katalizatzen duten edozein ligasa dira.

Artikulu honetan, sintasa eta sintetasaren arteko aldea zehatz-mehatz ezagutuko duzu.

Zer da Synthase?

Sintasa biokimikan sintesi prozesua katalizatzen duen entzima bat da. Kontuan izan nomenklatura biologikoak hasieran sintetasak eta sintasak bereizten zituela.

Jatorrizko definizioaren arabera, sintetasek nukleosido trifosfatoak erabiltzen dituzte (adibidez, ATP, GTP, CTP, TTP eta UTP) energia iturri gisa, sintasek ez duten bitartean.

Hala ere, Nomenklatura Biokimikorako Batzorde Mistoaren (JCBN) arabera, "sintasa" sintesia katalizatzen duen edozein entzima izendatzeko erabil daiteke (nukleosido trifosfatoak erabiltzen dituen ala ez), baina "sintetasa". ” “ligasa” izendatzeko soilik erabili behar da.

Hona hemen sintasa mota ezberdinen adibideen zerrenda:

• ATP sintasa
• Zitrato sintasa
• Triptofanoasintesia katalizatzen duen edozein entzima izendatzeko erabil daiteke (nukleosido trifosfatoak erabiltzen dituen ala ez), baina "sintetasa" "ligasa" izendatzeko soilik erabili behar da.

  Sintasa eta sintetasaren arteko bereizketa nagusia da. Sintetasa molekulen artean loturak sor ditzakeen entzima familia bat dela, eta Sintasa, berriz, entzima bat da.

  Sintasa	Sintetasa
  ATPrik gabeko prozesu sintetiko bat katalizatzen du	ATP behar du
  Loreontzi edo transferasa sailkapenean sartzen da	Ligasen sailkapenaren pean dator
  adib. HMG-COA sintasa, ATP sintasa	adib. Succiny1-COA sintetasa, Glutamina sintetasa Ikusi ere: "Euliak" VS "Euliak" (Gramatika eta erabilera) - Desberdintasun guztiak

  Sintetasa eta sintetasa Konparazio taula

  Ikusi bideo hau sintasa eta sintetasa buruz jakiteko

  Ondorioa

  • Sintetaseek ez dute NTPrik behar funtzionatzeko, nukleosido trifosfatoen (ez ATP soil) hidrolisia behar zuten prozesu sintetikoak katalizatzen baitzituzten.
  • Nazioarteko Batasuna. Biokimikako Nomenklatura Batzordeak sintasaren definizioa aldatu zuen 1980ko hamarkadan, entzima sintetiko guztiak barne hartzeko, NTPak erabili ala ez, eta sintetasa ligasaren sinonimo bihurtu zen.
  • Ligasa bi molekula txikiagoak elkarrekin lotzen dituen entzima da. NTP hidrolisitik datorren energia (normalean kondentsazio baten bidez).erreakzioa).
  sintasa
• Pseudouridina sintasa
• Gantz azido sintasa
• Zelulosa sintasa (UDP-a eratzen duena)
• Zelulosa-sintasa (GDP-a eratzen duena)

ATP sintasa

Adenosina difosfatoa (ADP) eta fosfato ez-organikoa erabiltzen dira energia biltegiratzeko adenosina trifosfatoa (ATP) ATP sintasa (Pi) izeneko proteina baten bidez.

Ligasa gisa sailkatzen da, ADP aldatzen baitu P-O lotura (fosfodiester lotura) eratuz. ATP sintasa izeneko gailu molekularra.

Energia aldetik, ADP eta Pitik ATP ekoiztea ez da desiragarria, eta normalean prozesua beste bide batetik joango litzateke.

Protoi (H+) kontzentrazio-gradiente batek eukariotoetan barneko mintz mitokondrialean edo bakterioetan mintz plasmatikoan zehar erreakzio hau aurrera eramaten du arnasketa zelularrean zehar ATP sintesia gradientearekin lotuz.

Landareetan, ATP sintasak tilakoide-mintzean zehar eta kloroplastoen estroman sortzen den protoi-gradiente bat erabiltzen du. -ATPases funtzio hori "alderantziz". Mota hau batez ere artikulu honetan eztabaidatzen da. F-ATPasa baten FO eta F1 azpiunitateek ATP sintesia ahalbidetzen duen biraketa-mekanismo motorra dute.

Sintasa mota desberdinak daude

Zitrato Sintasa

Ia zelula bizi guztiek dute zitrato sintasa entzima,azido zitrikoaren zikloaren lehen urratsean taupada-markagailu gisa balio duena eta E.C. 2.3.3.1 izendatzen dena (aurretik 4.1.3.7). (edo Krebs zikloa).

Zitrato sintasa zelula eukariotoen matrize mitokondrialean dago, nahiz eta DNA nuklearrak, ez DNA mitokondriala, kodetzen duen.

Erribosoma zitoplasmatikoek zitoplasman sortzen dute eta, ondoren, matrize mitokondrialera mugitzen da.

Mitokondrio osorik izateko entzima-markatzaile kuantitatibo tipikoa zitrato sintasa da. Zitrato sintasaren jarduera gorenak erakusten du zenbat mitokondrio dauden hezur-muskuluan.

Intentsitate handiko tarteko entrenamenduak erresistentziako entrenamenduak edo intentsitate handiko tarteko entrenamenduak baino jarduera maximoa areagotzeko ahalmena du.

A azetil koentzimak bi karbonoko azetato hondakina eta lauko molekula ditu. -karbono oxaloazetatoa kondentsatzen da sei karbonoko zitratoa sortzeko, zitrato sintasak katalizatutako kondentsazio-erreakzioan sortzen dena.

Triptofano sintasa

Triptofanoa ekoizteko azken bi urratsak dira. triptofano sintasa entzimak katalizatuta, triptofano sintetasa bezala ere ezaguna.

Eubakterioak, Arkebakterioak, Protistak, Onddoak eta Landareak izaten dira maiz ostalariak. Hala ere, Animaliak ez dauka. Normalean, 2 2 tetramero gisa agertzen da.

Azpiunitateek indol-3-glizerol fosfatoaren bihurketa itzulgarria katalizatzen dute.indola eta glizeraldehido-3-fosfatoa (G3P) (IGP).

Piridoxal fosfatoaren (PLP) menpeko prozesu batean, azpiunitateek indolaren eta serinaren kondentsazio itzulezina katalizatzen dute triptofanoa sortzeko.

25 angstrom-ko luzera duen eta entziman kokatutako barne-kanal hidrofobiko batek gune aktibo bakoitza ondoko gune aktiboarekin lotzen du.

Horrek substratuaren kanalizazioa sustatzen du, gune aktiboetan indoloa sortzen duen mekanismoa. zuzenean beste gune aktiboetara zabaltzen da. Triptofano sintasak alosterikoki akoplatutako gune aktiboak ditu.

Eubakterioak, Arkebakterioak, Protistak, Onddoak eta Plantae triptofano sintasa barne hartzen dutela deskubritzen da maiz. Gizakiek eta beste animaliek falta dute.

Gizakientzako beharrezkoak diren bederatzi aminoazidoetako bat, triptofanoa hogei aminoazido estandarretako bat da. Triptofanoa ezinbestekoa da, beraz, giza elikadurarako.

Ere jakina da triptofano sintetasak indolaren analogoak erabil ditzakeela, indol fluoratuak edo metilatutakoak adibidez, substratu gisa triptofanoaren analogo baliokideak ekoizteko.

Pseudouridina

Psi- letra greziarra pseudouridina laburtzeko erabiltzen da, uridina nukleosidoaren isomeroa, zeinetan urakiloa karbono-atomoarekin lotzen den karbono-karbono lotura baten bidez nitrogeno-karbono lotura glikosidiko baten bidez baino. (Urakilo noizean behin "pseudouracil" deitzen zaio antolamendu honetan.)

RNA nagusienaARN zelularren alterazioa pseudouridina da. RNAk transkripzioan eta sintesian zehar 100 aldaketa kimiko berezi baino gehiago jasan ditzake.

Ohiko lau nukleotidoez gain, hauek transkripzio osteko RNAren adierazpenean eragina izan dezakete eta zelulan hainbat funtzio izan ditzakete, besteak beste, RNAren itzulpena, lokalizazioa eta egonkortasuna.

Horietako bat pseudouridina da, uridinaren C5-glukosido isomeroa, erribosa azukrearen C1 eta uraziloaren C5 arteko C-C lotura duena, uridinan dagoen C1-N1 lotura tipikoaren ordez.

Rotazio-mugikortasun gehigarria eta konformazio-malgutasuna ditu C-C lotura dela eta. Horrez gain, pseudouridinaren N1 posizioak hidrogeno-lotura emaile gehigarri bat dauka.

Pseudouridina, 5-ribosiluracil ere deitua, RNA estrukturalen (transferentzia, erribosomikoa, nuklear txikia (snRNA) eta osagai ezaguna baina misteriotsua da). nukleola txikia). Duela gutxi aurkitu da RNA kodetzean ere.

Detektatu den lehena izan zen, nagusiena da eta bizitzako hiru eboluzio-eremuetan aurki daiteke. Legamiaren tRNA-n, pseudouridinak nukleotidoen % 4 inguru egiten du.

Urarekin hidrogeno-lotura gehigarrien eraketaren bidez, base-alterketa hau RNA egonkortzeko eta base-pilaketa hobetzeko gai da. pseudouridina kopurua organismo baten konplexutasunarekin hazten da. Bertan 11 pseudouridina daudeEscherichia coli-ren rRNA, 30 legamia rRNA zitoplasmikoan, alterazio bat 21S rRNA mitokondrialean eta 100 gutxi gorabehera gizakien rRNAn. eta eskualde-egitura egonkortzen du eta mRNA deskodetzen, erribosomaren muntaian, prozesatzen eta itzulpenean duten eginkizunak mantentzen laguntzen du.

Frogatuta dago snRNAn pseudouridinak pre-mRNA eta RNA spliceosomalaren arteko interfazea hobetzen duela, splicinga erregulatzen laguntzeko.

Gantz-azidoen sintasea

FASN gizakietan geneak gantz azido sintasa (FAS) izenez ezagutzen den entzima kodetzen du. Gantz-azido sintasa izeneko entzima anitzeko proteinak gantz-azidoen sintesia katalizatzen du.

Sistema entzimatiko oso bat da, ez entzima bakarra, substratuak domeinu funtzional batetik bestera transferitzen dituzten 272 kDa-ko bi polipeptido funtzio anitzeko berdinez osatua.

Bere eginkizun nagusia NADPH erabiltzea da palmitatoa (C16:0, kate luzeko gantz-azido saturatua) azetil- eta malonil-CoA-tik azetil- eta malonil-CoAren sorrera katalizatzeko.

Azetil-CoA eta malonilotik -CoA gantz-azido bihurtzen da Claisen dekarboxilatiboen kondentsazio-prozesuen sekuentzia baten bidez.

Luzapen txanda bakoitzaren ondoren, ketoreduktasa (KR), deshidratasa (DH) eta enoil erreduktasa bat segidan lan egiten dute beta keto taldea guztiz saturatu den karbono-katera murrizteko.(ER).

Gantz-azidoen katea 16 karbonoko luzera izatera iritsi denean, tioesterasa (TE) baten eraginez askatzen da, zeina kobalenteki lotuta dagoen proteina azil eramaile baten (ACP) fosfoanteteina talde protesikoarekin. (azido palmitikoa).

Zelulosa-sintasa (UDP-Eraketa)

Zelulosa ekoizteaz arduratzen den entzima nagusia zelulosa-sintasa (EC 2.4.1.12) UDP-a eratzen duen forman da. Orokorrean, UDP-glukosa deitzen zaio: (1→4) Entzimologiako 4-D-glukosiltransferasa D-glukanorako.

GDP-glukosa zelulosa sintasa (GDP-) deritzon entzima erlazionatu batek erabiltzen du. eratuz) (EC 2.4.1.29). Bai bakterioek bai landareek entzima-familia honetako kideak dituzte.

BcsA (bakterio zelulosa sintasa) edo CelA bezala ere ezagutu daitezke bakterio kideak, eta landare kideak normalean CesA (zelulosa sintasa) edo CslA espekulatiboa (zelulosa sintasa antzekoa) ("zelulosa" besterik ez) bezala ezagutzen dira. .

CesA landareek kloroplastoa sortu zuen endosinbiosiaren ondorioz eskuratu zuten. Glukosiltransferasaren 2. familia hau barne hartzen du (GT2).

Lurreko biomasaren gehiengoa glikosiltransferasa izeneko entzimen bidez biosintesiaren eta hidrolisiaren bidez ekoizten da.

CesA landareen superfamiliak duela jakina da. zazpi azpifamilia, eta landare-alga superfamilia konbinatuak 10 ditu.

Entzima hau duen animalia talde bakarra da.urokordatuak, duela 530 milioi urte baino gehiago gene transferentzia horizontalaren bidez lortu zuten.

Zelulosa Sintasa (GDP-Forming)

Glukosiltransferasen hexosiltransferasa azpifamiliako kidea da entzima hau. Entzima-klase honi bere izen zientifikoari esaten zaio, GDP-glukosa:1,4-beta-D-glukan 4-beta-D-glukosiltransferasa.

Maiz erabiltzen diren beste izen batzuk zelulosa sintasa (guanosina difosfato eratzailea), zelulosa sintetasa eta guanosina difosfoglukosa-1,4-beta-glukano glukosiltransferasa dira. Entzima honek sakarosaren eta almidoiaren metabolismoan parte hartzen du.

Zer da sintetasa?

"Sintetasa" terminoa, batzuetan "ligasa" izenez ezagutzen dena, energia kimikoa kontserbatzeko erreakzio kimikoak katalizatzen dituen eta energia kontsumitzen duten matxura-gertaeren eta produkzio-gertaeren arteko bitartekaritza egiten duen gutxi gorabehera 50 entzimako edozein motari egiten dio erreferentzia. prozesu sintetikoak.

Fosfato-lotura energetikoa apurtuz, bi molekularen konbinazioa katalizatzeko beharrezko energia sortzen dute (kasu askotan, adenosina trifosfatoa [ATP] adenosina difosfatoa [ADP] aldi berean bihurtzean). .

Aminoazido-RNA ligasa izenez ezagutzen den ligasa transferentzia RNA eta aminoazido baten artean karbono-oxigeno loturaren sorrera katalizatzen duena da.

Entzima jakin batzuk, hala nola amida-sintetasak eta peptido-sintetasak, aktibo daudenean, karbono-nitrogenoa (C-N)loturak sortzen dira.

Sintetasa Ligasa izenez ere ezagutzen da.

Sintetasa eta sintasaren arteko aldea

Sintetasa elkartzea kataliza dezakeen entzima bat da. bi molekula handi lotura kimiko berri bat sortuz, normalean talde kimiko zintzilikario txiki baten aldibereko hidrolisiarekin molekula handienetako batean, edo bi konposatuen lotura kataliza dezake, hala nola C-O, C-S, C-N, etab.

Ligas batek normalean erreakzio hau gertatzea eragiten du:

• A-C + b = Ab + C
• A+D + B + C + D + E + F = Ab + cD

Mendeko talde txikiak letra xehez adierazten direnean. Ligasak erreplikazioan zehar kate bikoitzeko DNAn garatzen diren kate bakarreko hausturak konpon ditzake, baita azido nukleiko osagarri bi zati lotu ere.

Bestalde, sintasa biokimikan sintesi-prozesua katalizatzen duen entzima bat da. Lyases kategorian sartzen dira EC zenbakien kategorizazioaren arabera.

Nomenklatura

Kontuan izan nomenklatura biologikoak hasieran sintetasak eta sintasak bereizten zituela. Jatorrizko definizioaren arabera, sintetasek nukleosido trifosfatoak erabiltzen dituzte (adibidez, ATP, GTP, CTP, TTP eta UTP) energia iturri gisa, sintasek ez duten bitartean.

Hala ere, Nomenklatura Biokimikorako Batzorde Mistoaren arabera (JCBN), "sintasa"