E.C. 6 kelas énzim ligase ngawengku sintase jeung sintétase. Aranjeunna ilubiung dina réaksi sintétik sarta ngatalisan gabungan dua molekul bari sakaligus megatkeun tumbu difosfat dina ATP atawa trifosfat comparable séjén.

Sabalikna jeung sintétase, nu ngagunakeun ATP salaku sumber énergi salila sintésis. tina sanyawa biologis, sintase nyaéta ligase naon waé anu ngatalisan sintésis sanyawa biologis tanpa ngagunakeun ATP salaku sumber énergi.

Dina artikel ieu, anjeun bakal terang persis bédana antara Synthase sareng Synthetase.

Naon Dupi Synthase?

Sintase nyaéta énzim anu ngatalisan prosés sintésis dina biokimia. Émut yén tata ngaran biologis mimitina dibédakeun antara sintétase sareng sintase.

Luyu jeung definisi aslina, sintétase ngagunakeun nukléosida trifosfat (saperti ATP, GTP, CTP, TTP, jeung UTP) salaku sumber énergi sedengkeun sintase henteu.

Tapi, numutkeun Joint Commission on Biochemical Nomenclature (JCBN), "synthase" tiasa dianggo pikeun ngarujuk kana sagala énzim anu ngatalisan sintésis (teu paduli naha éta ngagunakeun nukléosida trifosfat), tapi "sintétase". ” ngan ukur dianggo pikeun ngarujuk kana "ligase".

Di handap ieu daptar conto tipena béda sintase:

• ATP sintase
• Sintase sitrat
• Triptofanbisa dipaké pikeun ngarujuk kana sagala énzim anu ngatalisan sintésis (teu paduli naha éta ngagunakeun nukléosida trifosfat), tapi "sintétase" ngan ukur dianggo pikeun ngarujuk kana "ligase". yén Synthetase mangrupa kulawarga énzim nu bisa ngahasilkeun beungkeutan antarmolekul, sedengkeun Synthase mangrupa énzim.

  Synthase	Sintetase
  Katalisis prosés sintétik tanpa ATP	Merlukeun ATP
  Asalna dina klasifikasi vas atawa transferase	Asup kana klasifikasi ligase
  misalna. HMG-COA sintase, ATP sintase	misalna. Succiny1-COA synthetase, Glutamine synthetase

  Synthase vs Synthetase Tabél Perbandingan

  Tonton Video Ieu Pikeun Nyaho Ngeunaan Synthase vs Synthetase

  Kacindekan

  • Sintetases teu merlukeun NTPs pikeun fungsina sabab ngatalisan prosés sintétik nu merlukeun hidrolisis nukléosida trifosfat (sanes ngan saukur ATP).
  • The International Union of Komite Nomenklatur Biokimia ngarobah definisi sintase dina taun 1980-an pikeun ngawengku sakabéh énzim sintétik, naha maranéhna ngagunakeun NTP atawa henteu, sarta sintétase jadi sinonim jeung ligase.
  • Ligase mangrupa énzim nu ngagabung dua molekul leutik babarengan ku ngamangpaatkeun énergi ti hidrolisis NTP (biasana ngaliwatan kondensasiréaksi).
  sintase
• Pseudouridine sintase
• Sintase asam lemak
• Sintase Selulosa (ngabentuk UDP)
• Sintase Selulosa (ngabentuk GDP)

ATP Synthase

Adénosin difosfat (ADP) jeung fosfat anorganik dipaké pikeun nyieun molekul panyimpen énergi adénosin trifosfat (ATP) ku protéin nu disebut ATP sintase (Pi).

Ieu dikategorikeun salaku ligase sabab ngarobih ADP ku ngabentuk tautan P-O (beungkeut fosfodiester). Alat molekular anu disebut ATP synthase.

Sacara énérgi, produksi ATP tina ADP sareng Pi henteu dipikahoyong, sareng prosésna biasana bakal jalan anu sanés.

Gradién konséntrasi proton (H+) peuntas mémbran mitokondria jero dina eukariota atawa mémbran plasma dina baktéri ngadorong réaksi ieu ka hareup ku cara ngagabungkeun sintésis ATP salila réspirasi sélular jeung gradién.

Dina tutuwuhan, ATP sintase ngagunakeun gradién proton anu dibentuk dina lumén tilakoid meuntas mémbran tilakoid jeung kana stroma kloroplas pikeun ngahasilkeun ATP salila fotosintésis.

Pikeun ATPase, sintase ATP eukariot nyaéta F. -ATPases anu fungsina "sabalikna." Jenis ieu utamana dibahas dina artikel ieu. Subunit FO jeung F1 tina F-ATPase boga mékanisme motor rotasi anu ngamungkinkeun sintésis ATP.

Aya tipena béda Sintase

Sintase Sitrat

Ampir kabéh sél hirup ngandung énzim sitrat sintase,nu boga fungsi minangka pacemaker dina hambalan kahiji tina siklus asam sitrat sarta ditunjuk E.C.. 2.3.3.1 (saméméhna 4.1.3.7). (atawa siklus Krebs).

Sintase sitrat aya dina matriks mitokondria sél eukariot, sanajan DNA inti, lain DNA mitokondria, ngodekeunana.

Dijieun dina sitoplasma ku ribosom sitoplasma tuluy dipindahkeun kana matriks mitokondria.

Tanda énzim kuantitatif has pikeun ayana mitokondria gembleng nyaéta sintase sitrat. Aktivitas puncak sintase sitrat nembongkeun sabaraha mitokondria anu aya dina otot rangka.

Latihan interval inténsitas tinggi boga potensi pikeun ngaronjatkeun aktivitas maksimum leuwih ti latihan daya tahan atawa latihan interval inténsitas tinggi.

Asetil koénzim A boga résidu dua-karbon asétat jeung molekul opat. -karbon oksaloasetat kondensasi pikeun ngahasilkeun genep karbon sitrat, anu dihasilkeun ku réaksi kondensasi anu dikatalisis ku sintase sitrat.

Tryptophan Synthase

Dua léngkah ahir dina produksi triptofan nyaéta dikatalisis ku énzim triptofan sintase, ogé katelah triptofan sintétase.

Eubacteria, Archaebacteria, Protista, Fungi, jeung Plantae sering jadi sarwa. Nanging, Animalia henteu gaduhna. Biasana, éta muncul salaku 2 2 tetramer.

Subunit ngatalisan konvérsi malik indole-3-gliserol fosfat jadiindol jeung gliseraldehida-3-fosfat (G3P) (IGP).

Dina prosés gumantung piridoksal fosfat (PLP), subunit ngatalisan kondensasi indol jeung serin nu teu bisa balik pikeun ngahasilkeun triptofan.

Saluran hidrofobik internal anu panjangna 25 angstrom sareng aya dina énzim ngahubungkeun unggal situs aktip ka situs aktip anu padeukeut.

Ieu ngamajukeun saluran substrat, mékanisme dimana indole dihasilkeun dina situs aktip. diffuses langsung ka loka aktip séjén. Tryptophan synthase ngandung situs aktif anu gandeng sacara alosterik.

Eubacteria, Archaebacteria, Protista, Fungi, jeung Plantae remen kapanggih kaasup triptofan sintase. Manusa jeung sato lianna kakurangan eta.

Salah sahiji salapan asam amino nu dipikabutuh pikeun manusa, triptofan mangrupa salah sahiji tina dua puluh asam amino baku. Ku alatan éta, triptofan penting pisan pikeun dahareun manusa.

Éta ogé dipikanyaho yén triptofan sintétase tiasa nganggo analog indole, sapertos indoles fluorinated atanapi métilasi, salaku substrat pikeun ngahasilkeun analog triptofan anu sami.

Pseudouridine

Huruf Yunani psi- dipaké pikeun singketan pseudouridine, hiji isomér tina uridin nukléosida nu urasil dihijikeun jeung atom karbon ku tumbu karbon-karbon tinimbang sambungan glikosidik nitrogén-karbon. (Uracil kadang-kadang disebut "pseudouracil" dina susunan ieu.)

RNA paling umumparobahan dina RNA sélular nyaéta pseudouridine. RNA bisa ngalaman leuwih 100 parobahan kimiawi unik salila transkripsi jeung sintésis.

Salian ti opat nukléotida konvensional, ieu berpotensi mangaruhan éksprési RNA pas-transkripsi sarta mibanda sababaraha fungsi dina sél, kaasup tarjamahan RNA, lokalisasi, jeung stabilitas.

Salah sahijina nyaéta pseudouridine, isomér C5-glikosida uridin kalawan beungkeut C-C antara C1 gula ribosa jeung C5 urasil gaganti beungkeut C1-N1 has dina uridin.

Mibanda mobilitas rotasi tambahan sareng kalenturan konformasi kusabab beungkeut C-C. Sajaba ti éta, posisi N1 pseudouridine mibanda hiji donor beungkeut hidrogén tambahan.

Pseudouridine, disebut oge 5-ribosyluracil, mangrupakeun komponén akrab acan misterius RNA struktural (transfer, ribosom, nuklir leutik (snRNA), jeung nukléolar leutik). Ieu nembe kapanggih dina coding RNA ogé.

Éta anu pangheulana dideteksi, anu paling umum, sareng tiasa dipendakan dina tilu domain évolusionér kahirupan. Dina tRNA ragi, pseudouridine nyieun kira-kira 4% tina nukléotida

Ngaliwatan formasi beungkeut hidrogén tambahan jeung cai, alterasi basa ieu bisa nyaimbangkeun RNA jeung ningkatkeun base-stacking.

The Jumlah pseudouridines tumuwuh kalayan kompleksitas hiji organisme. Aya 11 pseudouridines dinarRNA Escherichia coli, 30 dina rRNA sitoplasma ragi, hiji robahan dina mitokondria 21S rRNA, sarta kasarna 100 dina rRNA manusa.

Ieu geus nunjukkeun yén pseudouridine dina rRNA jeung tRNA fine-tunes. sarta stabilizes struktur régional jeung AIDS dina pangropéa kalungguhan maranéhanana di mRNA decoding, assembly ribosom, processing, sarta tarjamahan.

Geus nunjukkeun yén pseudouridine dina snRNA ningkatkeun panganteur antara pre-mRNA jeung RNA spliceosomal pikeun mantuan ngatur splicing.

Fatty Acid Synthase

FASN gén dina manusa ngodekeun énzim nu katelah fatty acid synthase (FAS). Protéin multi-énzim anu disebut sintase asam lemak ngatalisan sintésis asam lemak.

Ieu mangrupa sakabéh sistem énzimatik, lain ngan hiji énzim, diwangun ku dua polipéptida multifungsi 272 kDa idéntik anu mindahkeun substrat tina hiji domain fungsional ka domain salajengna.

Tugas utamana ngagunakeun NADPH pikeun ngatalisan kreasi palmitat (C16:0, asam lemak jenuh ranté panjang) tina asetil- jeung malonyl-KoA

Asetil-KoA jeung malonyl. -CoA dirobah jadi asam lemak ngaliwatan runtuyan prosés kondensasi Claisen decarboxylative.

Nuturkeun unggal babak pemanjangan, hiji ketoreduktase (KR), dehidratase (DH), jeung enoyl réduktase gawé dina urutan pikeun ngurangan gugus béta keto kana ranté karbon lengkep jenuh.(ER).

Nalika ranté asam lemak geus tumuwuh nepi ka panjangna 16 karbon, éta dileupaskeun ku aksi tioesterase (TE), nu disambungkeun sacara kovalén jeung gugus prostétik fosfopantéin tina protéin pembawa asil (ACP) (asam palmitat).

Selulosa Synthase (UDP-Forming)

Enzim primér anu tanggung jawab pikeun ngahasilkeun selulosa nyaéta selulosa sintase (EC 2.4.1.12) dina wangun UDP-na. Biasana disebut UDP-glukosa: (1→4) 4-D-glucosyltransferase Enzymology pikeun D-glucan.

GDP-glukosa dipaké ku énzim nu patali disebut cellulose synthase (GDP- ngabentuk) (EC 2.4.1.29). Duanana baktéri jeung tutuwuhan boga anggota kulawarga énzim ieu.

Anggota baktéri bisa ogé katelah BcsA (bacterial cellulose synthase) atawa CelA, sedengkeun anggota tutuwuhan ilaharna katelah CesA (selulosa sintase) atawa spekulatif CslA (selulosa sintase-kawas) (saukur "selulosa") .

CesA kaala ku tutuwuhan salaku hasil tina éndosimbiosis nu ngalahirkeun kloroplas. Kulawarga 2 tina glucosyltransferases kaasup hiji ieu (GT2).

Seuseueurna biomassa di Bumi dihasilkeun ngaliwatan biosintésis jeung hidrolisis ku énzim nu disebut glycosyltransferases.

Tutuwuhan superfamili CesA dipikanyaho ngandung tujuh subfamili, jeung gabungan tutuwuhan-alga superfamili ngandung 10.

Satu-hijina grup sato nu mibanda ieu énzim nyaétaurochordates, anu diala ngaliwatan transfer gén horizontal leuwih ti 530 juta taun ka tukang.

Selulosa Synthase (GDP-Forming)

Énzim ieu mangrupa anggota subfamili hexosyltransferase of glycosyltransferases. Kelas énzim ieu disebut ku nami ilmiahna, GDP-glukosa: 1,4-beta-D-glucan 4-beta-D-glucosyltransferase.

Ngaran séjén anu mindeng dipaké nyaéta selulosa sintase (guanosine diphosphate-forming), selulosa sintétase, jeung guanosine diphosphoglucose-1,4-beta-glucan glucosyltransferase. Énzim ieu aub dina métabolisme sukrosa sareng pati.

Naon Synthetase?

Istilah "synthetase," sok katelah "ligase," nujul kana salah sahiji kelas tina kira-kira 50 énzim anu ngatalisan réaksi kimiawi-conserving énergi jeung mediasi antara kajadian ngarecahna-consuming énergi jeung produktif. prosés sintétik.

Ku cara megatkeun beungkeut fosfat energetik, maranéhna ngahasilkeun énergi nu diperlukeun pikeun ngatalisis gabungan dua molekul (dina loba kasus, ku konversi simultaneous adénosin trifosfat [ATP] jadi adénosin difosfat [ADP]) .

A ligase katelah asam amino-RNA ligase nyaéta ligase nu ngatalisan kreasi beungkeut karbon-oksigén antara RNA mindahkeun jeung asam amino.

Nalika énzim nu tangtu, kayaning sintetase amida, jeung sintetase péptida, aktip, karbon-nitrogen (C-N)beungkeut dihasilkeun.

Sintetase ogé katelah Ligase

Beda Antara Synthetase jeung Synthase

Sintetase mangrupa énzim nu bisa ngatalisan gabungan tina dua molekul badag ku cara nyieun beungkeut kimia anyar, ilaharna kalawan hidrolisis simultaneous gugus kimia pendant leutik dina salah sahiji molekul nu leuwih gede, atawa bisa ngatalisan linking dua sanyawa, kayaning ngagabung C-O, C-S, C-N, jsb

A ligase ilaharna ngabalukarkeun réaksi handap lumangsung:

• A-C + b = Ab + C
• A+D + B + C + D + E + F = Ab + cD

Dimana gumantungna, grup leutik digambarkeun ku hurup leutik. Ligase bisa ngalereskeun putus-untai tunggal nu tumuwuh dina DNA untai ganda salila réplikasi ogé ngaitkeun dua fragmen asam nukléat komplementer.

Sabalikna, sintase mangrupa énzim nu ngatalisis prosés sintésis dina biokimia. Aranjeunna nuju kalebet kana kategori lyases dumasar kana kategorisasi nomer EC.

Nomenklatur

Perhatikeun yén tata ngaran biologis mimitina dibédakeun antara sintétase jeung sintase. Luyu jeung harti aslina, sintétase ngagunakeun nukléosida trifosfat (saperti ATP, GTP, CTP, TTP, jeung UTP) salaku sumber énergi sedengkeun sintase henteu.

Tapi, numutkeun Joint Commission on Biochemical Nomenclature (JCBN), "synthase"