La E.C. 6 klaso de ligazenzimoj inkludas sintazojn kaj sintetazojn. Ili partoprenas en sintezaj reagoj kaj katalizas la kombinadon de du molekuloj dum samtempe rompas la difosfatan ligon en ATP aŭ alia komparebla trifosfato.

Kontraste al sintetazoj, kiuj uzas ATP kiel fonton de energio dum la sintezo. de biologiaj komponaĵoj, sintazoj estas ajnaj ligazoj, kiuj katalizas la sintezon de biologiaj komponaĵoj sen uzi ATP kiel energifonton.

En ĉi tiu artikolo, vi ekkonos precize la diferencon inter Sintazo kaj Sintetazo.

Kio Estas Synthase?

Sintezazo estas enzimo kiu katalizas la sintezprocezon en biokemio. Memoru, ke la biologia nomenklaturo komence distingis inter sintetazoj kaj sintazoj.

Konforme al la originala difino, sintezazoj utiligas nukleozidtrifosfatojn (kiel ekzemple ATP, GTP, CTP, TTP kaj UTP) kiel fonton de energio dum sintazoj ne faras.

Tamen, laŭ la Komuna Komisiono pri Biokemia Nomenklaturo (JCBN), "sintetazo" povas esti uzata por rilati al iu ajn enzimo kiu katalizas sintezon (sendepende ĉu ĝi uzas nukleozidtrifosfatojn), sed "sintetazo". ” devus esti uzata nur por rilati al “ligazo.”

Jen listo de ekzemploj de malsamaj specoj de sintazo:

• ATP-sintetazo
• Citratsintezazo
• Triptofanopovas esti uzata por rilati al iu ajn enzimo kiu katalizas sintezon (sendepende de ĉu ĝi uzas nukleozidtrifosfatojn), sed "sintetazo" devus esti uzata nur por rilati al "ligazo."

  La primara distingo inter Sintetazo kaj Sintetazo estas ke Sintetazo estas familio de enzimoj kiuj povas generi ligojn inter molekuloj, dum Sintetazo estas enzimo.

  Sintazo	>Sintetazo
  Katalizas sintezan procezon sen ATP	Bezonas ATP
  Venas sub vaza aŭ transferaza klasifiko	Venas sub ligaza klasifiko
  ekz. HMG-COA-sintezazo, ATP-sintezazo	ekz. Succiny1-COA-sintetazo, Glutamino sintetazo

  Sintetazo vs sintetazo Kompartabelo

  Rigardu ĉi tiun videon por scii pri sintetazo vs sintetazo

  Konkludo

  • Sintetazoj ne bezonas NTP-ojn por funkcii ĉar ili katalizis sintezajn procezojn kiuj postulis la hidrolizon de nukleozidtrifosfatoj (ne simple ATP).
  • La Internacia Unio de La Nomenklatura Komitato de Biokemio ŝanĝis la difinon de sintazo en la 1980-aj jaroj por ampleksi ĉiujn sintezajn enzimojn, ĉu ili uzis aŭ ne NTP-ojn, kaj sintetazo iĝis sinonima kun ligazo.
  • Ligaso estas enzimo kiu kunigas du pli malgrandajn molekulojn kune uzante la energio de NTP-hidrolizo (kutime tra kondensadoreago).
  sintazo
• Pseŭdouridinsintezitazo
• Grasacida sintazo
• Celuloza sintazo (UDP-formanta)
• Celulozo-sintazo (GDP-formanta)

ATP-sintezazo

Adenozina difosfato (ADP) kaj neorganika fosfato estas uzataj por krei la energistokan molekulon adenozina trifosfato (ATP) per proteino nomata ATP-sintetazo (Pi).

Ĝi estas kategoriigita kiel ligazo ĉar ĝi modifas ADP per formado de P-O-ligo (fosfodiestera ligo). Molekula aparato nomata ATP-sintezazo.

Energie, la produktado de ATP el ADP kaj Pi estas nedezirinda, kaj la procezo kutime irus al la alia vojo.

Protona (H+) koncentriĝgradiento trans la interna mitokondria membrano en eŭkariotoj aŭ la plasmomembrano en bakterioj antaŭenpuŝas tiun reagon kunligante ATP-sintezon dum ĉela spirado al la gradiento.

En plantoj, ATP-sintezo uzas protonan gradienton formitan en la tilakoidlumo trans la tilakoidmembrano kaj en la kloroplastan stromon por produkti ATP dum fotosintezo.

Por ATPazo, eŭkariotaj ATP-sintezo estas F. -ATPazas tiu funkcio "inversa." Ĉi tiu speco estas ĉefe diskutita en ĉi tiu artikolo. La FO kaj F1-subunuoj de F-ATPazo havas rotacian motoran mekanismon kiu ebligas ATP-sintezon.

Ekzistas malsamaj specoj de Synthase

Citrate Synthase

Preskaŭ ĉiuj vivantaj ĉeloj enhavas la enzimon citrato sintazo,kiu funkcias kiel korstimulilo en la unua paŝo de la ciklo de citrata acido kaj estas nomita E.C. 2.3.3.1 (antaŭe 4.1.3.7). (aŭ Krebs-ciklo).

Citrato-sintetazo situas en la mitokondria matrico de eŭkariotaj ĉeloj, kvankam nuklea DNA, ne mitokondria DNA, ĉifras ĝin.

Ĝi estas kreita en la citoplasmo de citoplasmaj ribosomoj kaj poste movita en la mitokondrian matricon.

Tipa kvanta enzimsigno por la ekzisto de sendifektaj mitokondrioj estas citratsintazo. La pinta agado de Citratsintezazo rivelas kiom da mitokondrioj ĉeestas en skeletmuskolo.

Altintensa intervaltrejnado havas la eblecon altigi maksimuman agadon pli ol aŭ eltenivan trejnadon aŭ altintensan intervaltrejnadon.

Acetilkoenzimo A havas du-karbonan acetatrestaĵon kaj molekulon de kvar. -karbona oksaloacetato kondensiĝas por generi ses-karbonan citraton, kiu estas produktita de la kondensa reago katalizita de citrato-sintetazo.

Triptofana sintaza

La finaj du paŝoj en la produktado de triptofano estas katalizite per la enzimo triptofansintetazo, ankaŭ konata kiel triptofansintetazo.

Eŭbakterioj, Arkebakterioj, Protistoj, Fungoj kaj Plantoj estas oftaj gastigantoj de ĝi. Tamen, Animalia ne havas ĝin. Kutime, ĝi aperas kiel 2 2 tetramero.

La subunuoj katalizas la reigeblan konvertiĝon de indol-3-glicerolfosfato alindolo kaj gliceraldehido-3-fosfato (G3P) (IGP).

En piridoksa fosfato (PLP) dependa procezo, la subunuoj katalizas la nemaligeblan kondensadon de indolo kaj serino por generi triptofanon.

Interna hidrofoba kanalo, kiu longas 25 angstromojn kaj situas en la enzimo, ligas ĉiun aktivan lokon al la apuda aktiva loko.

Tio antaŭenigas substratan kanaligon, mekanismon per kiu indolo produktita ĉe aktivaj lokoj. disvastiĝas rekte al aliaj aktivaj retejoj. Triptofansintezazo enhavas alostere kunligitajn aktivajn ejojn.

Eŭbakterioj, Arkebakterioj, Protistoj, Fungoj kaj Plantae estas ofte malkovritaj por inkludi triptofansintezazon. Homoj kaj aliaj bestoj mankas ĝin.

Unu el la naŭ necesaj aminoacidoj por homoj, triptofano estas unu el la dudek normaj aminoacidoj. Triptofano estas do esenca al la homa dieto.

Estas ankaŭ konata, ke triptofansintetazo povas uzi indolanalogaĵojn, kiel fluorigitaj aŭ metiligitaj indoloj, kiel substratoj por produkti la ekvivalentajn triptofananalogaĵojn.

Pseŭdouridino

La greka litero psi- estas uzata por mallongigi pseŭdouridinon, izomero de la nukleozida uridino en kiu la uracilo estas kunligita al la karbonatomo per karbona-karbona ligo prefere ol nitrogen-karbona glikozida ligo. (Uracilo estas foje referita kiel "pseŭdouracilo" en ĉi tiu aranĝo.)

La plej ĝenerala RNAŝanĝo en ĉela RNA estas pseŭdouridino. RNA povas sperti pli ol 100 kemie unikajn ŝanĝojn dum transskribo kaj sintezo.

Aldone al la kvar konvenciaj nukleotidoj, tiuj eble povus influi RNA-esprimon post-transskriba kaj havi kelkajn funkciojn en la ĉelo, inkluzive de RNA-tradukado, lokalizo kaj stabileco.

Unu el tiuj estas pseŭdouridino, C5-glikozida izomero de uridino kun C-C ligo inter la C1 de la ribosa sukero kaj la C5 de uracilo anstataŭe de la tipa C1-N1 ligo ĉeestanta en uridino.

Ĝi havas kroman rotacian moviĝeblon kaj konformigan flekseblecon pro la C-C ligo. Krome, la pozicio N1 de pseŭdouridino posedas plian hidrogenligan donacanton.

Pseŭdouridino, ankaŭ nomata 5-ribosiluracilo, estas konata tamen mistera komponanto de strukturaj RNAoj (transigo, ribosoma, malgranda nuklea (snRNA), kaj malgranda nukleo). Ĝi estis ĵus trovita en kodigado de RNA ankaŭ.

Ĝi estis la unua detektita, estas la plej ĝenerala, kaj troveblas en ĉiuj tri evoluaj domajnoj de la vivo. En la gista tRNA, pseŭdouridino faras proksimume 4% de la nukleotidoj

Per la formado de kromaj hidrogenaj ligoj kun akvo, tiu bazŝanĝo povas stabiligi RNA kaj plibonigi bazstakadon. nombro da pseŭdouridinoj kreskas kun la komplekseco de organismo. Estas 11 pseŭdouridinoj enla rRNA de Escherichia coli, 30 en la citoplasma rRNA de gisto, unu ŝanĝo en la mitokondria 21S rRNA, kaj ĉirkaŭ 100 en la rRNA de homoj. kaj stabiligas la regionan strukturon kaj helpas pri la prizorgado de iliaj roloj en mRNA-malkodado, ribosomasembleo, pretigo kaj traduko.

Estas pruvite, ke pseŭdouridino en snRNA plibonigas la interfacon inter antaŭ-mRNA kaj la spliceosomal RNA por helpi reguligi splisadon.

Grasa Acida sintaza

La FASN geno en homoj ĉifras la enzimon konatan kiel grasacida sintazo (FAS). Multenzima proteino nomata grasacida sintaza katalizas la sintezon de grasacidoj.

Ĝi estas tuta enzima sistemo, ne nur unu enzimo, konsistanta el du identaj 272 kDa multfunkciaj polipeptidoj kiuj transdonas substratojn de unu funkcia domajno al la sekva.

Ĝia ĉefa tasko estas uzi NADPH por katalizi la kreadon de palmitato (C16:0, longĉena saturita grasacido) el acetil- kaj malonil-CoA

Acetil-CoA kaj malonil -CoA estas konvertita en grasajn acidojn per sekvenco de decarboxilativaj Claisen-kondensadprocezoj.

Sekvante ĉiun rondon de plilongigo, ketoreduktazo (KR), dehidratazo (DH), kaj enoilreduktazo funkcias sinsekve por malpliigi la beta-ketogrupon al la tute saturita karbonĉeno.(ER).

Kiam la grasacida ĉeno kreskis ĝis longeco de 16 karbonoj, ĝi estas liberigita per la ago de tioesterazo (TE), kiu estas kovalente ligita al la fosfopanteina prostetika grupo de acil portanta proteino (ACP) (palmita acido).

Celuloza sintaza (UDP-Formado)

La ĉefa enzimo respondeca por produktado de celulozo estas celuloza sintaza (EC 2.4.1.12) en sia UDP-forma formo. Ĝi estas ĝenerale referita kiel UDP-glukozo: (1→4) La 4-D-glukosiltransferazo de Enzimologio por D-glukano.

GDP-glukozo estas uzata de rilata enzimo nomita celulozosintezazo (GDP-). formante) (EC 2.4.1.29). Kaj bakterioj kaj plantoj havas membrojn de ĉi tiu familio de enzimoj.

Bakteriaj membroj ankaŭ povas esti konataj kiel BcsA (bakteria celulozosintezazo) aŭ CelA, dum plantmembroj estas tipe konataj kiel CesA (celulozosintezilazo) aŭ la konjekta CslA (celulozosintezi-simila) (simple "celulozo"). .

CesA estis akirita de plantoj kiel rezulto de la endosimbiozo kiu estigis la kloroplaston. Familio 2 el la glukosiltransferazoj inkluzivas ĉi tiun (GT2).

La plimulto de la biomaso sur la Tero estas produktita per biosintezo kaj hidrolizo per enzimoj nomataj glikosiltransferazoj.

La superfamilio de la planto CesA estas konata enhavi. sep subfamilioj, kaj la kombinita plant-alga superfamilio enhavas 10.

La sola besta grupo kiu posedas ĉi tiun enzimon estas laurokordatoj, kiuj akiris ĝin per horizontala gentransigo antaŭ pli ol 530 milionoj da jaroj.

Celuloza sintaza (MEP-Formado)

Tiu enzimo estas membro de la subfamilio de hexosiltransferazoj de glikosiltransferazoj. Ĉi tiu enzimklaso estas referita sub sia scienca nomo, GDP-glucose:1,4-beta-D-glucan 4-beta-D-glucosyltransferase.

Aliaj nomoj, kiuj estas ofte uzataj, estas celulozo-sintetazo (guanozina difosfat-forma), celulozo-sintetazo kaj guanozin-difosfoglukozo-1,4-beta-glukan-glukosiltransferazo. Ĉi tiu enzimo partoprenas en la metabolo de sakarozo kaj amelo.

Kio Estas Sintetazo?

La esprimo "sintetazo", foje konata kiel "ligazo", rilatas al iu ajn el klaso de ĉirkaŭ 50 enzimoj, kiuj katalizas kemiajn energi-ŝparantajn reagojn kaj mediacias inter energikonsumantaj kolapsokazaĵoj kaj produktivaj. sintezaj procezoj.

Fendante energian fosfatan ligon, ili generas la necesan energion por katalizi la kombinadon de du molekuloj (en multaj kazoj, per la samtempa konvertiĝo de adenozintrifosfato [ATP] al adenozindifosfato [ADP]) .

Ligazo konata kiel aminoacida-RNA ligazo estas tiu, kiu katalizas la kreadon de karbon-oksigena ligo inter transiga RNA kaj aminoacido.

Kiam certaj enzimoj, kiel amidsintetazoj, kaj peptidsintezazoj, estas aktivaj, karbonitrogeno (C-N)ligoj estas produktitaj.

Sintetazo ankaŭ estas konata kiel Ligazo

Diferenco Inter Sintetazo kaj Sintetazo

Sintetazo estas enzimo kiu povas katalizi la kuniĝon de du grandaj molekuloj kreante novan kemian ligon, tipe kun la samtempa hidrolizo de malgranda pendanta kemia grupo sur unu el la pli grandaj molekuloj, aŭ ĝi povas katalizi la ligon de du kunmetaĵoj, kiel ekzemple la kunigo de C-O, C-S, C-N, ktp. .

Ligazo tipe kaŭzas la sekvan reagon okazi:

• A-C + b = Ab + C
• A+D + B + C + D + E + F = Ab + cD

Kie la dependaj, etaj grupiĝoj estas reprezentitaj per minusklaj literoj. Ligazo povas ripari unu-fadenajn rompiĝojn kiuj disvolvas en duoble-fadena DNA dum reproduktado kaj ankaŭ ligas du komplementajn nukleacidajn fragmentojn.

Aliflanke, sintazo estas enzimo kiu katalizas la sintezprocezon en biokemio. Ili estas inkluzivitaj en la kategorion de liazoj laŭ la EC-nombra kategoriigo.

Nomenklaturo

Memoru, ke la biologia nomenklaturo komence distingis inter sintezazoj kaj sintezoj. Konforme al la origina difino, sintezazoj utiligas nukleozidtrifosfatojn (kiel ekzemple ATP, GTP, CTP, TTP, kaj UTP) kiel fonton de energio dum sintazoj ne faras.

Tamen, laŭ la Komuna Komisiono pri Biokemia Nomenklaturo (JCBN), "sintazo"