De EC 6-klasse fan ligase-enzymen omfettet synthases en synthetases. Se dogge mei oan syntetyske reaksjes en katalysearje it kombinearjen fan twa molekulen, wylst se tagelyk de difosfaatferbining yn ATP of in oar fergelykber trifosfaat brekke.

Yn tsjinstelling ta synthetases, dy't ATP brûke as enerzjyboarne by de synteze fan biologyske ferbiningen, syntases binne alle ligasen dy't de synteze fan biologyske ferbiningen katalysearje sûnder ATP as enerzjyboarne te brûken.

Yn dit artikel sille jo krekt it ferskil witte tusken Synthase en Synthetase.

Wat is synthase?

In synthase is in enzyme dat it syntezeproses yn biogemy katalysearret. Hâld der rekken mei dat de biologyske nomenklatuer ynearsten ûnderskied makke tusken synthetases en synthases.

Yn oerienstimming mei de orizjinele definysje brûke synthetasen nukleosidetrifosfaten (lykas ATP, GTP, CTP, TTP, en UTP) as in boarne fan enerzjy, wylst synthases dat net dogge.

Dochs kin, neffens de Joint Commission on Biochemical Nomenclature (JCBN), "synthase" wurde brûkt om te ferwizen nei elk enzym dat synteze katalyseart (nettsjinsteande oft it nukleosidetrifosfaten brûkt), mar "synthetase" " moat allinich brûkt wurde om te ferwizen nei "ligase."

Hjir is in list mei foarbylden fan ferskate soarten syntase:

• ATP-syntase
• Sitraatsyntase
• Tryptofaankin brûkt wurde om te ferwizen nei elk enzym dat synteze katalyseart (nettsjinsteande oft it nukleosidetrifosfaten brûkt), mar "synthetase" moat allinich brûkt wurde om te ferwizen nei "ligase."

  It primêre ûnderskied tusken synthase en synthetase is dat Synthetase in famylje fan enzymen is dy't ferbiningen tusken molekulen generearje kinne, wylst Synthase in enzym is.

  Synthase	Synthetase
  Katalysearret in syntetyske proses sûnder ATP	Fereasket ATP
  Komt ûnder faas of transferase-klassifikaasje	Komt ûnder ligaseklassifikaasje
  bgl. HMG-COA-syntase, ATP-syntase	bgl. Succiny1-COA synthetase, Glutamine synthetase

  Synthase vs Synthetase Fergelikingstabel

  Besjoch dizze fideo om te witten oer synthase vs synthetase

  Konklúzje

  • Synthetasen hawwe gjin NTP's nedich om te funksjonearjen, om't se syntetyske prosessen katalysearren dy't de hydrolyse fan nukleosidetrifosfaten (net gewoan ATP) nedich hawwe.
  • The International Union of Biochemistry's Nomenclature Committee feroare de definysje fan synthase yn 'e jierren '80 om alle synthetyske enzymen te omfetsje, al of net se NTP's brûkten, en synthetase waard synonym mei ligase.
  • Ligase is in enzyme dat twa lytsere molekulen byinoar bringt troch it brûken fan de enerzjy út NTP hydrolyse (meastentiids troch in kondensaasjereaksje).
  syntase
• Pseudouridine syntase
• Fetsoersyntase
• Sellulosesyntase (UDP-foarmjende)
• Sellulosesyntase (GDP-foarmjende)

ATP Synthase

Adenosine diphosphate (ADP) en anorganysk fosfaat wurde brûkt om it enerzjyopslachmolekule adenosinetrifosfaat (ATP) te meitsjen troch in proteïne neamd ATP synthase (Pi).

It is kategorisearre as in ligase, om't it ADP feroaret troch it foarmjen fan in P-O-keppeling (fosfodiesterbân). In molekulêr apparaat neamd ATP-syntase.

Enerzjy is de produksje fan ATP út ADP en Pi net winsklik, en it proses soe typysk de oare kant op gean.

In proton (H+) konsintraasjegradient oer it binnenste mitochondriale membraan yn eukaryoten as it plasmamembraan yn baktearjes driuwt dizze reaksje foarút troch ATP-synteze te koppelen tidens sellulêre respiraasje oan 'e gradient.

Yn planten brûkt ATP-syntase in proton-gradient foarme yn it thylakoid-lumen oer it thylakoid-membraan en yn it chloroplaststroma om ATP te meitsjen by fotosynteze.

Foar in ATPase binne eukaryote ATP-syntases F -ATPases dy't "omkearde" funksjonearje. Dit soarte wurdt primêr besprutsen yn dit artikel. De FO- en F1-subunits fan in F-ATPase hawwe in rotaasjemotormeganisme dy't ATP-synthese mooglik makket.

Der binne ferskate soarten Synthase

Citrate Synthase

Hast alle libbene sellen befetsje it enzyme citrate synthase,dy't tsjinnet as pacemaker yn 'e earste stap fan' e sitroenzuursyklus en wurdt oanwiisd E.C. 2.3.3.1 (earder 4.1.3.7). (of Krebs-syklus).

Citrate synthase leit yn 'e mitochondriale matrix fan eukaryote sellen, hoewol nukleêre DNA, net mitochondrial DNA, it kodearret.

It wurdt makke yn it cytoplasma troch cytoplasmyske ribosomen en ferpleatst dêrnei yn 'e mitochondriale matrix.

In typyske kwantitative enzymmarker foar it bestean fan yntakte mitochondria is citrate synthase. De peakaktiviteit fan citratesyntase lit sjen hoefolle mitochondria oanwêzich binne yn skeletspier.

Intervaltraining mei hege yntinsiteit hat it potensjeel om maksimale aktiviteit mear te ferheegjen as úthâldingsfermogen of yntervaltraining mei hege yntinsiteit. -carbon oxaloacetate condenses to generearje seis-koalstof citrate, dat wurdt produsearre troch de kondensaasje reaksje katalysearre troch citrate synthase. katalysearre troch it enzyme tryptofan synthase, ek wol bekend as tryptofan synthetase.

Eubacteria, Archaebacteria, Protista, Fungi en Plantae binne faak gasthearen foar it. Animalia hat it lykwols net. Gewoanlik ferskynt it as in 2 2 tetramer.

De subunits katalysearje de reversibele konverzje fan indole-3-glycerolfosfaat neiindole en glyceraldehyde-3-fosfaat (G3P) (IGP).

Yn in pyridoxal fosfaat (PLP) ôfhinklik proses katalysearje de subunits de ûnomkearbere kondensaasje fan indole en serine om tryptofan te generearjen.

In ynterne hydrofoob kanaal dat 25 Angstrom lang is en leit yn it enzyme ferbynt elke aktive side mei de neistlizzende aktive side.

Dit befoarderet substraatkanalearring, in meganisme wêrmei't indole op aktive plakken produsearre wurdt. diffús direkt nei oare aktive siden. Tryptofaansyntase befettet allosterysk keppele aktive siden.

Eubakteria, Archaebacteria, Protista, Fungi en Plantae wurde faak ûntdutsen om tryptofan synthase te befetsjen. Minsken en oare bisten misse it.

Ien fan 'e njoggen needsaaklike aminosoeren foar minsken, tryptofan is ien fan 'e tweintich standert aminosoeren. Tryptofaan is dêrom essinsjeel foar it minsklik dieet.

It is ek bekend dat tryptofansynthetase indoleanalogen brûke kin, lykas fluorinearre of methylearre indoles, as substraten om de lykweardige tryptofananalogen te meitsjen.

Pseudouridine

De Grykske letter psi- wurdt brûkt om pseudouridine ôf te koartsjen, in isomeer fan it nukleoside uridine wêryn it uracil ferbûn is mei it koalstofatoom troch in koalstof-koalstofferbining yn stee fan in stikstof-koalstof glycoside ferbining. (Uracil wurdt yn dizze regeling sa no en dan "pseudouracil" neamd.)

De meast foarkommende RNAferoaring yn sellulêre RNA is pseudouridine. RNA kin mear as 100 gemysk unike feroaringen ûndergean tidens transkripsje en synteze.

Neist de fjouwer konvinsjonele nukleotiden kinne dizze mooglik post-transkripsjoneel ynfloed op RNA-ekspresje en hawwe in oantal funksjes yn 'e sel, ynklusyf RNA-oersetting, lokalisaasje en stabiliteit.

Ien fan dizze is pseudouridine, in C5-glycoside-isomer fan uridine mei in CC-bân tusken de C1 fan 'e ribose-sûker en de C5 fan uracil yn plak fan' e typyske C1-N1-bân oanwêzich yn uridine.

It hat ekstra rotaasjemobiliteit en konformaasjefleksibiliteit fanwegen de CC-bân. Dêrnjonken hat de N1-posysje fan pseudouridine in ekstra wetterstofbândonor.

Pseudouridine, ek wol 5-ribosyluracil neamd, is in fertroud noch mysterieuze komponint fan strukturele RNA's (oerdracht, ribosomale, lytse nukleêre (snRNA), en lytse nukleolêre). It waard koartlyn ek fûn yn kodearjen fan RNA.

It wie de earste dy't waard ûntdutsen, is de meast foarkommende, en kin fûn wurde yn alle trije evolúsjonêre domeinen fan it libben. Yn it gist-tRNA makket pseudouridine sa'n 4% fan 'e nukleotiden. oantal pseudouridines groeit mei de kompleksiteit fan in organisme. D'r binne 11 pseudouridines ynit rRNA fan Escherichia coli, 30 yn it cytoplasmyske rRNA fan gist, ien feroaring yn it mitochondriale 21S rRNA, en rûchwei 100 yn it rRNA fan minsken.

It is oantoand dat pseudouridine yn rRNA en tRNA fine-tunes en stabilisearret de regionale struktuer en helpt by it ûnderhâld fan har rollen yn mRNA-dekodearring, ribosommontage, ferwurking en oersetting.

It is oantoand dat pseudouridine yn snRNA de ynterface tusken pre-mRNA en it spliceosomal RNA ferbettert om help te regeljen fan splicing.

Fatty Acid Synthase

De FASN gen yn minsken kodearret it enzyme bekend as fatty acid synthase (FAS). In multi-enzymeprotein neamd fatty acid synthase katalysearret de synteze fan fatty soeren.

It is in folslein enzymatysk systeem, net allinich ien enzym, opboud út twa identike 272 kDa multyfunksjonele polypeptiden dy't substraten oerdrage fan it iene funksjonele domein nei it folgjende.

Syn primêre taak is om NADPH te brûken om de skepping fan palmitaat (C16: 0, in lange keten verzadigde fatty acid) te katalysearjen fan acetyl- en malonyl-CoA

Acetyl-CoA en malonyl -CoA wurde omset yn fatty soeren troch in folchoarder fan decarboxylative Claisen kondensaasje prosessen.

Nei elke rûnte fan ferlinging wurkje in ketoreduktase (KR), dehydratase (DH), en enoylreduktase yn sekwinsje om de beta-keto-groep te ferminderjen nei de folslein verzadigde koalstofketen(ER).

As de fatty acid keten is útgroeid ta in lingte fan 16 koalstof, wurdt it frijlitten troch de aksje fan in thioesterase (TE), dy't kovalent ferbûn is mei de phosphopantetheine prosthetic groep fan in acyl carrier protein (ACP) (palmitinezuur).

Cellulosesyntase (UDP-foarmjen)

It primêre enzym dat ferantwurdlik is foar it produsearjen fan cellulose is cellulosesyntase (EC 2.4.1.12) yn syn UDP-foarmjende foarm. It wurdt algemien oantsjutten as UDP-glucose: (1→4) Enzymology's 4-D-glucosyltransferase foar D-glucan.

GDP-glucose wurdt brûkt troch in besibbe enzyme neamd cellulosesyntase (GDP- foarmje) (EC 2.4.1.29). Sawol baktearjes as planten hawwe leden fan dizze famylje fan enzymen.

Bakteriële leden kinne ek bekend wurde as BcsA (bakteriële cellulose synthase) of CelA, wylst plant leden binne typysk bekend as CesA (cellulose synthase) of de spekulative CslA (cellulose synthase-like) (gewoan "cellulose") .

CesA waard oankocht troch planten as gefolch fan de endosymbioaze dy't oanlieding joech ta de chloroplast. Famylje 2 fan 'e glucosyltransferases omfettet dizze (GT2).

De mearderheid fan 'e biomassa op ierde wurdt produsearre troch biosynteze en hydrolyse troch enzymen neamd glycosyltransferases.

De plant CesA superfamily is bekend om te befetsjen sân subfamyljes, en de kombinearre plant-algen superfamylje befettet 10.

De ienige bistegroep dy't dit enzyme hat is deurochordates, dy't it krigen troch horizontale gentransfer mear as 530 miljoen jier lyn.

Cellulose Synthase (GDP-Forming)

Dit enzyme is lid fan 'e hexosyltransferase subfamylje fan glycosyltransferases. Dizze enzymklasse wurdt oantsjutten troch syn wittenskiplike namme, GDP-glucose: 1,4-beta-D-glucan 4-beta-D-glucosyltransferase.

Oare nammen dy't faak brûkt wurde binne cellulose synthase (guanosine diphosphate-foarmjen), cellulose synthetase, en guanosine diphosphoglucose-1,4-beta-glucan glucosyltransferase. Dit enzyme nimt belutsenens by it metabolisme fan sukrose en setmoal.

Wat is synthetase?

De term "synthetase", soms bekend as "ligase", ferwiist nei ien fan in klasse fan sawat 50 enzymen dy't gemyske enerzjybesparjende reaksjes katalysearret en bemiddelet tusken enerzjyferbrûkende ôfbraakeveneminten en produktive syntetyske prosessen.

Troch it spjalten fan in enerzjike fosfaatbân generearje se de nedige enerzjy om it kombinearjen fan twa molekulen te katalysearjen (yn in protte gefallen troch de simultane omsetting fan adenosinetrifosfaat [ATP] nei adenosine difosfaat [ADP]) .

In ligase bekend as in aminosoer-RNA-ligase is ien dy't de skepping katalysearret fan in koalstof-soerstofbân tusken in oerdracht RNA en in aminosoer.

As bepaalde enzymen, lykas amidesynthetasen, en peptidesynthetasen, aktyf binne, koalstofstikstof (C-N)bindingen wurde produsearre.

Synthetase is ek bekend as Ligase

Ferskil tusken Synthetase en Synthase

In synthetase is in enzyme dat it gearfoegjen fan katalysearje kin twa grutte molekulen troch it meitsjen fan in nije gemyske bân, typysk mei de simultane hydrolyse fan in lytse oanhingjende gemyske groep op ien fan 'e gruttere molekulen, of it kin it ferbinen fan twa ferbiningen katalysearje, lykas it ferbinen fan CO, C-S, C-N, ensfh.

In ligase feroarsake typysk de folgjende reaksje:

• A-C + b = Ab + C
• A+D + B + C + D + E + F = Ab + cD

Dêr't de ôfhinklike, lytse groepearrings wurde fertsjintwurdige troch lytse letters. Ligase kin single-string breaks reparearje dy't ûntwikkelje yn dûbele-stringed DNA tidens replikaasje en ek twa komplementêre nukleïnesûrfragminten keppelje.

Oan de oare kant is synthase in enzyme dat it syntezeproses yn biogemy katalysearret. Se binne opnommen yn 'e kategory lyases neffens de EC-nûmerkategorisearring.

Nomenklatuer

Hâld der rekken mei dat de biologyske nomenklatuer ynearsten ûnderskied makke tusken synthetasen en synthases. Yn oerienstimming mei de oarspronklike definysje brûke synthetasen nukleosidetrifosfaten (lykas ATP, GTP, CTP, TTP, en UTP) as in boarne fan enerzjy, wylst syntasen dat net dogge.

Dochs, neffens de Joint Commission on Biochemical Nomenclature (JCBN), "synthase"