Класата E.C. 6 на лигаза ензими вклучува синтази и синтетази. Тие учествуваат во синтетички реакции и го катализираат комбинирањето на две молекули додека истовремено ја прекинуваат дифосфатната врска во АТП или друг споредлив трифосфат.

За разлика од синтетазите, кои користат АТП како извор на енергија за време на синтезата од биолошките соединенија, синтазите се сите лигази кои ја катализираат синтезата на биолошките соединенија без користење на АТП како извор на енергија.

Во оваа статија, точно ќе ја запознаете разликата помеѓу Синтаза и Синтетаза.

Што е синтаза?

Синтаза е ензим кој го катализира процесот на синтеза во биохемијата. Имајте на ум дека биолошката номенклатура првично прави разлика помеѓу синтетази и синтази.

Во согласност со оригиналната дефиниција, синтетазите користат нуклеозидни трифосфати (како што се ATP, GTP, CTP, TTP и UTP) како извор на енергија додека синтазите не го користат.

Сепак, според Заедничката комисија за биохемиска номенклатура (JCBN), „синтаза“ може да се користи за да се однесува на кој било ензим што ја катализира синтезата (без разлика дали користи нуклеозид трифосфати), но „синтетаза " треба да се користи само за да се однесува на "лигаза."

Еве листа на примери на различни видови синтаза:

• ATP синтаза
• Цитратна синтаза
• Триптофанможе да се користи за да се однесува на кој било ензим што ја катализира синтезата (без разлика дали користи нуклеозидни трифосфати), но „синтетаза“ треба да се користи само за да се однесува на „лигаза“.

  Примарната разлика помеѓу синтаза и синтетаза е дека Синтетазата е фамилија на ензими кои можат да генерираат врски помеѓу молекулите, додека синтазата е ензим>Синтетаза Катализира синтетички процес без АТП Потребен е АТП Станува под класификација на вазна или трансфераза Станува под класификација на лигаза на пр. HMG-COA синтаза, ATP синтаза на пр. Succiny1-COA синтетаза, глутамин

  синтетаза

  Синтаза и синтетаза споредбена табела

  Гледајте го ова видео за да знаете за синтаза наспроти синтетаза

  Заклучок

  • На синтетазите не им се потребни НТП за да функционираат бидејќи тие катализираа синтетички процеси кои бараа хидролиза на нуклеозидни трифосфати (не само АТП).
  • Меѓународната унија на Комитетот за номенклатура на биохемија ја смени дефиницијата за синтаза во 1980-тите за да ги опфати сите синтетички ензими, без разлика дали тие користеле НТП или не, а синтетазата стана синоним за лигаза.
  • Лигазата е ензим кој спојува две помали молекули заедно со користење на енергија од НТП хидролиза (обично преку кондензацијареакција).
  синтаза
• Псеудуридин синтаза
• Синтаза на масни киселини
• Синтаза на целулоза (образува UDP)
• Целулоза синтаза (формирачки GDP)

АТП синтаза

Аденозин дифосфат (ADP) и неоргански фосфат се користат за создавање на молекулата за складирање на енергија аденозин трифосфат (ATP) од протеин наречен АТП синтаза (Пи).

Таа е категоризирана како лигаза бидејќи го модифицира ADP со формирање на P-O врска (фосфодиестерска врска). Молекуларна направа наречена АТП синтаза.

Енергетски, производството на АТП од ADP и Pi е непожелно, а процесот обично оди на друг начин.

Градиентот на концентрација на протон (H+) низ внатрешната митохондријална мембрана кај еукариотите или плазматската мембрана кај бактериите ја поттикнува оваа реакција напред со спојување на синтезата на АТП за време на клеточното дишење до градиентот.

Кај растенијата, АТП синтазата користи градиент на протон формиран во тилакоидниот лумен низ тилакоидната мембрана и во стромата на хлоропластот за да произведе АТП за време на фотосинтезата.

За АТП-аза, еукариотските АТП синтази се F -ATPaзи кои функционираат „обратно“. Овој вид првенствено се дискутира во оваа статија. FO и F1 подединици на F-ATP-аза имаат ротационен моторен механизам кој овозможува синтеза на ATP.

Постојат различни типови на синтаза

Цитратна синтаза 1> Речиси сите живи клетки го содржат ензимот цитрат синтаза,кој служи како пејсмејкер во првиот чекор од циклусот на лимонска киселина и е означен E.C. 2.3.3.1 (претходно 4.1.3.7). (или Кребсов циклус).

Цитрат синтаза се наоѓа во митохондријалната матрица на еукариотските клетки, иако ја шифрира нуклеарната ДНК, а не митохондријалната ДНК.

Се создава во цитоплазмата од цитоплазматските рибозоми и последователно се преместува во митохондријалната матрица.

Типичен квантитативен ензимски маркер за постоење на непроменети митохондрии е цитрат синтаза. Врвната активност на цитрат синтазата открива колку митохондрии се присутни во скелетните мускули.

Интервалниот тренинг со висок интензитет има потенцијал да ја подигне максималната активност повеќе од тренинзите за издржливост или тренинзите со висок интензитет.

Ацетил коензимот А има остаток од два јаглерод ацетат и молекула од четири -јаглерод оксалоацетат се кондензира за да генерира шестјаглероден цитрат, кој се произведува со реакцијата на кондензација катализирана од цитрат синтаза.

Триптофан синтаза

Последните два чекори во производството на триптофан се катализиран од ензимот триптофан синтаза, познат и како триптофан синтетаза.

Eubacteria, Archaebacteria, Protista, Fungi и Plantae се чести домаќини на него. Сепак, Animalia го нема. Обично, се појавува како 2 2 тетрамер.

Подединиците ја катализираат реверзибилната конверзија на индол-3-глицерол фосфат воиндол и глицералдехид-3-фосфат (G3P) (IGP).

Во процес зависен од пиридоксал фосфат (PLP), субединиците ја катализираат неповратната кондензација на индол и серин за да генерираат триптофан.

Внатрешен хидрофобен канал кој е долг 25 ангстроми и се наоѓа во ензимот го поврзува секое активно место со соседното активно место.

Ова го промовира канализирањето на подлогата, механизам со кој индол се произведува на активни места дифузира директно на други активни места. Триптофан синтаза содржи алостерично поврзани активни места.

Евбактерии, архебактерии, протиста, габи и плантае често се откриени дека вклучуваат триптофан синтаза. На луѓето и на другите животни им недостига.

Една од деветте неопходни аминокиселини за луѓето, триптофанот е една од дваесетте стандардни амино киселини. Според тоа, триптофанот е неопходен за човечката исхрана.

Исто така, познато е дека триптофан синтетазата може да користи индоли аналози, како што се флуорирани или метилирани индоли, како супстрати за производство на еквивалентни аналози на триптофан.

Псевдуридин

Грчката буква psi- се користи за скратување на псеудуридин, изомер на нуклеозидот уридин во кој урацилот е споен со јаглеродниот атом со врска јаглерод-јаглерод наместо азот-јаглерод гликозидна врска. (Урацилот повремено се нарекува „псевдуурацил“ во овој аранжман.)

Најраспространетата РНКпромената на клеточната РНК е псеудуридин. РНК може да претрпи над 100 хемиски уникатни промени за време на транскрипцијата и синтезата.

Покрај четирите конвенционални нуклеотиди, овие може потенцијално да влијаат на експресијата на РНК пост-транскрипционално и да имаат голем број функции во клетката, вклучувајќи транслација на РНК, локализација и стабилност.

Еден од нив е псеудуридин, C5-гликозиден изомер на уридин со C-C врска помеѓу C1 на рибозниот шеќер и C5 на урацил на местото на типичната C1-N1 врска присутна во уридин.

Има дополнителна ротациона мобилност и конформациска флексибилност поради врската C-C. Покрај тоа, N1 позицијата на псеудуридин поседува дополнителен донатор на водородна врска.

Псевдуридин, исто така наречен 5-рибозилурацил, е позната, но мистериозна компонента на структурните РНК (трансфер, рибозомална, мала нуклеарна (snRNA) и мали нуклеоларни). Неодамна беше пронајден и во кодирање на РНК.

Прв беше откриен, најраспространет е и може да се најде во сите три еволутивни домени на животот. Во tRNA на квасецот, псеудуридин прави околу 4% од нуклеотидите

Преку формирање на дополнителни водородни врски со вода, оваа промена на базата може да ја стабилизира РНК и да го подобри натрупувањето на базите.

бројот на псеудуридини расте со сложеноста на организмот. Има 11 псевдуридини воrRNA на Escherichia coli, 30 во цитоплазматската rRNA на квасецот, една промена во митохондријалната 21S rRNA и приближно 100 во rRNA на луѓето.

Докажано е дека псеудуридин во rRNA и tRNA и ја стабилизира регионалната структура и помага во одржувањето на нивните улоги во декодирањето на mRNA, склопувањето на рибозомите, обработката и транслацијата.

Докажано е дека псеудуридин во snRNA ја подобрува интерфејсот помеѓу пред-мРНК и спојната РНК за да помогне во регулирањето на спојувањето.

Синтаза на масни киселини

ФАСН генот кај луѓето го кодира ензимот познат како синтаза на масни киселини (FAS). Мулти-ензимски протеин наречен синтаза на масни киселини ја катализира синтезата на масни киселини.

Тоа е цел ензимски систем, а не само еден ензим, составен од два идентични мултифункционални полипептиди од 272 kDa кои пренесуваат супстрати од еден функционален домен во друг.

Нејзината примарна работа е да користи NADPH за катализирање на создавањето на палмитат (C16:0, заситена масна киселина со долг синџир) од ацетил- и малонил-CoA

Ацетил-CoA и малонил -CoA се претвораат во масни киселини преку низа од декарбоксилативни Claisen процеси на кондензација.

По секој круг на издолжување, кеторедуктаза (KR), дехидратаза (DH) и еноил редуктаза работат во низа за да ја намалат бета кето групата до целосно заситен јаглероден синџир(ЕР).

Кога синџирот на масни киселини ќе порасне во должина од 16 јаглероди, тој се ослободува со дејство на тиоестераза (ТЕ), која е ковалентно поврзана со фосфопантетеинската протетичка група на ацил-носител протеин (ACP) (палмитинска киселина).

Целулоза синтаза (образува UDP)

Примарниот ензим одговорен за производство на целулоза е целулоза синтаза (EC 2.4.1.12) во нејзината форма што формира UDP. Генерално се нарекува UDP-гликоза: (1→4) 4-D-глукозилтрансфераза на ензимологијата за Д-глукан.

GDP-гликозата се користи од сроден ензим наречен целулоза синтаза (GDP- формирање) (EC 2.4.1.29). И бактериите и растенијата имаат членови на ова семејство на ензими.

Бактериските членови може да бидат познати и како BcsA (бактериска целулоза синтаза) или CelA, додека членовите на растенијата обично се познати како CesA (целулозна синтаза) или шпекулативна CslA (како целулоза синтаза) (едноставно „целулоза“) .

CesA бил стекнат од растенијата како резултат на ендосимбиозата од која настанал хлоропластот. Фамилијата 2 на глукозилтрансферазите ја вклучува оваа (GT2).

Поголемиот дел од биомасата на Земјата се произведува преку биосинтеза и хидролиза од ензими наречени гликозилтрансферази.

Се знае дека суперсемејството на растенијата CesA содржи седум подфамилии, а комбинираната суперфамилија на растенија и алги содржи 10.

Единствената животинска група која го поседува овој ензим еурокордати, кои го добиле преку хоризонтален трансфер на гени пред повеќе од 530 милиони години.

Целулоза синтаза (ГДП-формирање)

Овој ензим е член на подфамилијата на хексосилтрансферази на гликозилтрансферази. Оваа класа на ензими се нарекува по нејзиното научно име, GDP-гликоза:1,4-бета-D-глукан 4-бета-D-глукозилтрансфераза.

Други имиња кои често се користат се целулоза синтаза (формирање на гванозин дифосфат), целулоза синтетаза и гванозин дифосфоглукоза-1,4-бета-глукан глукозилтрансфераза. Овој ензим е вклучен во метаболизмот на сахарозата и скробот.

Што е синтетаза?

Терминот „синтетаза“, понекогаш познат како „лигаза“, се однесува на кој било од класата на приближно 50 ензими кои катализираат хемиски реакции за зачувување на енергијата и посредуваат помеѓу настаните на распаѓање кои трошат енергија и продуктивни синтетички процеси.

Со расцепување на енергетска фосфатна врска, тие ја генерираат потребната енергија за катализирање на комбинирањето на две молекули (во многу случаи, со истовремена конверзија на аденозин трифосфат [ATP] во аденозин дифосфат [ADP]) .

Лигазата позната како амино киселинска-РНК лигаза е онаа која го катализира создавањето на јаглерод-кислородна врска помеѓу трансферната РНК и аминокиселината.

Кога одредени ензими, како што се амид синтетази и пептидни синтетази, се активни, јаглерод-азот (C-N)се произведуваат врски.

Синтетазата е позната и како Лигаза

Разликата помеѓу синтетазата и синтазата

Синтетазата е ензим кој може да го катализира спојувањето на две големи молекули со создавање на нова хемиска врска, обично со истовремена хидролиза на мала приврзана хемиска група на една од поголемите молекули, или може да го катализира поврзувањето на две соединенија, како што е спојувањето на C-O, C-S, C-N итн.

Лигазата обично предизвикува појава на следнава реакција:

• A-C + b = Ab + C
• A+D + B + C + D + E + F = Ab + cD

Каде што зависните, ситни групирања се претставени со мали букви. Лигазата може да ги поправа прекините на една жичка кои се развиваат во двоверижна ДНК за време на репликацијата, како и да поврзува два комплементарни фрагменти на нуклеинска киселина.

Од друга страна, синтазата е ензим кој го катализира процесот на синтеза во биохемијата. Тие се вклучени во категоријата на лиази според категоризацијата на EC броеви.

Номенклатура

Имајте на ум дека биолошката номенклатура првично прави разлика помеѓу синтетази и синтази. Во согласност со оригиналната дефиниција, синтетазите користат нуклеозидни трифосфати (како што се ATP, GTP, CTP, TTP и UTP) како извор на енергија додека синтазите не.

Сепак, според Заедничката комисија за биохемиска номенклатура (JCBN), „синтаза“