Çîna E.C. 6 ya enzîmên lîgazê sentaz û sentetazan pêk tîne. Ew beşdarî reaksiyonên sentetîk dibin û hevgirtina du molekulan katalîz dikin û di heman demê de girêdana dîfosfatê ya di ATP an trîfosfatek din a hevber de dişkînin. ji pêkhateyên biyolojîkî, sentaz her lîgaz in ku senteza pêkhateyên biyolojîk bêyî ku ATP wekî çavkaniyek enerjiyê bikar bînin katalîz dikin.

Di vê gotarê de, hûn ê tam ferqa di navbera Synthase û Synthetase de nas bikin.

Synthase çi ye?

Synthase enzîmek e ku di biyokîmyayê de pêvajoya sentezê katalîze dike. Bînin bîra xwe ku navoksaziya biyolojîk di destpêkê de di navbera synthetases û synthases de ji hev cihê dike.

Li gorî pênaseya orîjînal, synthetases trifosfatên nukleozîd (wek ATP, GTP, CTP, TTP, û UTP) wekî çavkaniyek enerjiyê bikar tînin dema ku synthases nakin.

Digel vê yekê, li gorî Komîsyona Hevbeş ya Navoksaziya Biyokîmyayî (JCBN), "synthase" dikare were bikar anîn ku ji her enzîma ku sentezê katalîze dike (bêyî ku ew trifosfatên nukleozîd bikar tîne), lê "senthetase" were bikar anîn. " divê tenê ji bo "ligaze" were bikar anîn.

Li vir navnîşek nimûneyên celebên synthase hene:

• ATP synthase
• Citrat synthase
• Trîptofandikare ji bo her enzîmek ku sentezê katalîze dike (bêyî ku ew trifosfatên nukleozîd bi kar tîne) were bikar anîn, lê divê "synthetase" tenê ji bo binavkirina "lîgazê" were bikar anîn.

  Cûdahiya bingehîn di navbera Synthase û Synthetase de ev e. ku Synthetase malbatek enzîman e ku dibe ku di navbera molekulan de girêdan çêbike, lê Synthase enzîmek e>Sinthetase Pêvajoyek sentetîk bêyî ATP katalîz dike ATP hewce dike Di bin dabeşkirina vase an transferase de ye Di bin dabeşkirina lîgazê de ye mînak. HMG-COA synthase, ATP synthase mînak. Succiny1-COA synthetase, Glutamine

  synthetase

  Synthase vs Synthetase Tabloya Berawirdkirinê

  Vê Vîdyoyê Temaşe Bikin Ku Di derheqê synthase vs synthetase de bizanin

  Encam

  • Synthetases ne hewceyî NTP-an in ku kar bikin ji ber ku wan pêvajoyên sentetîk ên ku hewcedariya hîdrolîza trifosfatên nukleozîd (ne tenê ATP) hewce dike, katalîz kirin.
  • Yekîtiya Navneteweyî ya Komîteya Nomenclature ya Biyokîmyayê di salên 1980-an de pênaseya synthase guhert da ku hemî enzîmên sentetîk bigire nav xwe, gelo ew NTP bikar tînin an na, û synthetase bû hevwateya lîgazê.
  • Ligase enzîmek e ku du molekulên piçûktir bi kar tîne enerjiya ji hîdrolîza NTP (bi gelemperî bi kondensasyonêreaksiyonê).
  synthase
• Pseudouridine synthase
• Fatty acid synthase
• Sellulos synthase (UDP-forming)
• Selulose synthase (GDP-forming)

ATP Synthase

Adenosine diphosphate (ADP) û fosfata neorganîk ji bo afirandina molekula hilanîna enerjiyê adenosine triphosphate (ATP) ji hêla proteînek bi navê ATP synthase (Pi) ve têne bikar anîn.

Ew wekî lîgazek tête kategorîzekirin ji ber ku ew ADP-ê bi avakirina girêdanek P-O (girêdanek fosfodiester) diguhezîne. Amûrek molekular a bi navê ATP synthase.

Ji hêla enerjiyê ve, hilberîna ATP ji ADP û Pi nexwestî ye, û pêvajo bi gelemperî rêyek din diçe.

Godek hûrgelê ya proton (H+) li seranserê membrana mitokondrî ya hundurîn di eukaryotan de an membrana plazmayê ya di bakteriyan de vê reaksiyonê ber bi pêş ve dikişîne bi hevberkirina senteza ATP-ê di dema nefeskirina hucreyî de berbi gradientê.

Di nebatan de, sentaza ATP gradientek protonê ya ku di lumena tîlakoidê de li seranserê parzûna tîlakoidê û di nav stroma kloroplastê de çêdibe bikar tîne da ku di dema fotosentezê de ATP hilberîne. -ATPasên ku "berepaş" dixebitin. Ev celeb di serî de di vê gotarê de tê nîqaş kirin. Yekîneyên FO û F1 yên F-ATPase xwedan mekanîzmayek motora zivirî ye ku senteza ATP-ê pêk tîne.

Cûreyên Synthase hene

Citrate Synthase

Hema hema hemî şaneyên zindî enzîma citrate synthase dihewîne,ku di gava yekem a çerxa asîda sîtrîk de wekî pacemaker kar dike û E.C. 2.3.3.1 (berê 4.1.3.7) tê destnîşan kirin. (an çerxa Krebsê).

Citrate synthase di matrixa mîtokondrî ya şaneyên eukaryotî de cih digire, her çend ADNya nukleerî, ne DNAya mîtokondrî, wê kod dike.

Ew di nav sîtoplazmayê de ji hêla rîbozomên sîtoplazmî ve tê çêkirin û dûv re derbasî nav matrixa mîtokondriyayê dibe.

Nîşkarek enzîmê ya jimarî ya tîpîk a ji bo hebûna mîtokondrîyên saxlem sîtrat syntaza ye. Çalakiya lûtkeya citrate synthase eşkere dike ka çend mîtokondrî di masûlkeyên skeletal de hene.

Perwerdehiya navberê ya bi tundî ya bilind xwedan potansiyela wê ye ku çalakiya herî zêde ji perwerdehiya bîhnfirehiyê an jî perwerdehiya navberê ya tundtir zêde bike.

Acetyl coenzyme A xwedan bermayiyên acetate du karbon û molekulek çar e. -Karbon oxaloacetate dişewite û sîtrata şeş-karbonê çêdike, ku ji ber reaksiyona kondensasyonê ya ku ji hêla sintaza sîtratê ve tê katalîz kirin, tê hilberandin. ji hêla enzîma trîptofan sentaza ve, ku wekî trîptofan sentetaz jî tê zanîn, tê katalîz kirin.

Eubacteria, Archaebacteria, Protista, Fungi, û Plantae gelek caran mêvandarên wê ne. Lêbelê, Animalia wê tune. Bi gelemperî, ew wekî 2 2 tetramer xuya dike.

Bin yekîneyan veguhertina vegerê ya indole-3-glycerol fosfate ji boindol û glyceraldehyde-3-phosphate (G3P) (IGP).

Di pêvajoyek girêdayî pyridoxal fosphate (PLP) de, binyekînen kondensasyona nevegera îndol û serînê katalîz dikin da ku trîptofan çêkin.

Kanalek hîdrofobîk a hundurîn ku 25 angstrom dirêj e û di enzîmê de cih digire, her cîhek çalak bi cîhê çalak ê cîranê ve girêdide.

Ev kanalîzasyona substratê pêşve dike, mekanîzmayek ku bi wê îndolê li cîhên çalak têne hilberandin. rasterast li ser malperên din ên çalak belav dibe. Tryptophan synthase cîhên çalak ên bi alosterîkî ve girêdayî ye.

Eubacteria, Archaebacteria, Protista, Fungi, and Plantae gelek caran têne keşif kirin ku trîptofan syntaza tê de hene. Mirov û heywanên din kêmasiya wê ne.

Yek ji neh asîdên amînî yên pêwîst ji bo mirovan, trîptofan yek ji bîst asîdên amînî yên standard e. Ji ber vê yekê trîptofan ji bo parêza mirovan girîng e.

Herwiha tê zanîn ku trîptofan synthetase dikare analogên îndolê, wek îndolên fluorinated an jî metilated, wekî substrate bikar bîne da ku analogên trîptofanê yên wekhev hilberîne.

Pseudouridine

Tîfa Yewnanî psi- ji bo kurtkirina pseudouridine, îzomerek uridine ya nukleozîdê ye ku tê de uracil ji hêla girêdanek karbon-karbonê ve li şûna girêdana nîtrojen-karbonê glycosîdîk bi atoma karbonê ve tê girêdan. (Di vê verastkirinê de Uracil carinan wekî "pseudouracil" tê binav kirin.)

ARN-ya herî berbelavGuherîna ARNya xaneyê pseudouridine ye. ARN dikare di dema veguheztin û sentezê de zêdetirî 100 guhertinên kîmyewî yên bêhempa derbas bibe.

Ji bilî çar nukleotîdên konvansiyonel, dibe ku ev bi potansiyel bandorê li îfadeya RNA-yê piştî-transkrîpsiyonê bikin û di şaneyê de çend fonksiyonên xwe hebin, di nav de wergerandina RNA, herêmîbûn û aramiyê.

Yek ji van pseudouridine ye, îzomerek C5-glycoside ya uridine bi girêdana C-C di navbera C1 ya şekirê ribose û C5 ya uracil de li şûna girêdana tîpîk C1-N1 ku di uridine de heye.

Ji ber girêdana C-C xwedan tevgeriya zivirî û nermbûna konformasyonê ya zêde ye. Wekî din, pozîsyona N1 ya pseudouridine xwedan donatorek pêveka hîdrojenê ya din jî heye.

Pseudouridine, ku jê re 5-ribosyluracil jî tê gotin, pêkhateyek naskirî lê nepenî ya RNA-yên avahîsaziyê ye (veguhestin, rîbosomal, nukleerek piçûk (snRNA), û navokî ya piçûk). Di van demên dawî de ew di kodkirina RNA de jî hate dîtin.

Ew ya yekem bû ku hate tesbît kirin, ya herî berbelav e, û dikare di her sê warên pêşveçûnê yên jiyanê de were dîtin. Di tRNAya hevîrtirşkê de, pseudouridine bi qasî %4 ji nukleotîdan pêk tîne

Bi avabûna bendên hîdrojenê yên zêde yên bi avê re, ev guherîna bingehîn dikare RNA-yê stabîl bike û lihevkirina bingehê zêde bike.

hejmara pseudouridines bi tevliheviya organîzmê mezin dibe. Di nav de 11 pseudouridine henerRNA ya Escherichia coli, 30 di rRNAya sîtoplazmî ya hevîrtirşkê de, yek guherandin di rRNAya 21S ya mîtokondrî de, û di rRNAya mirovan de bi qasî 100.

Hatiye pêşandan ku pseudouridine di rRNA û tRNA de çêdibe. û strûktûra herêmî stabîl dike û di domandina rolên wan de di dekodkirina mRNA, kombûna rîbozomê, pêvajokirin û wergerandinê de dibe alîkar.

Hatiye destnîşan kirin ku pseudouridine di snRNA de têkiliya navbera pre-mRNA û RNA-ya spliceosomal baştir dike da ku alîkariya birêkûpêkkirina hevgirtinê bike. genê di mirovan de enzîma ku bi navê asîda rûnê synthase (FAS) tê naskirin kod dike. Proteînek pir-enzîm a bi navê asîda rûnê sentaza senteza asîdên rûnê katalîze dike.

Ew pergalek enzîmîkî ya tevahî ye, ne tenê enzîmek, ji du polîpeptîdên pirfunctional ên 272 kDa yên yekane pêk tê ku substratan ji domenek fonksiyonel vediguhezîne ya din.

Karê wê yê bingehîn ew e ku NADPH bikar bîne da ku çêkirina palmîtat (C16:0, asîdek rûnê têrbûyî ya dirêj-zincîra dirêj) ji acetyl- û malonyl-CoA bikar bîne

Acetyl-CoA û malonyl. -CoA bi rêzek pêvajoyên kondensasyona dekarboksîlative Claisen ve vediguhezin asîdên rûnê.

Li dû her dora dirêjbûnê, ketoreductase (KR), dehydratase (DH), û enoyl reductase bi rêzê dixebitin ku koma beta keto kêm bikin zincîra karbonê ya bi tevahî têrbûyî.(ER).

Dema ku zincîra asîda rûnê bi dirêjahiya 16 karbonan mezin bû, ew bi çalakiya tîoesterazê (TE) tê berdan, ku bi koma protez a fosfopantetheîn a proteîna hilgirê acil (ACP) ve girêdayî ye. (Asîda palmîtîk).

Sentaza Celuloz (UDP-Çêkirin)

Enzîma sereke ya ku ji hilberîna selulozê berpirsyar e, sentaza selulozê ye (EC 2.4.1.12) bi forma wê ya ku UDP çê dike. Ew bi gelemperî wekî UDP-glucose tête binav kirin: (1→4) 4-D-glucosyltransferase ya enzîmolojiyê ji bo D-glukan.

GDP-glucose ji hêla enzîmek têkildar ve tête bikar anîn ku jê re syntaza cellulose (GDP-). damezrandin) (EC 2.4.1.29). Hem bakterî hem jî nebat endamên vê famîleya enzîman hene.

Endamên bakteriyan dikarin wekî BcsA (sentaza selulozê ya bakterî) an CelA jî werin zanîn, dema ku endamên nebatê bi gelemperî wekî CesA (sentaza selulozê) an CslA-ya spekulatîf (şelûloz sentaza-mîna) têne zanîn (bi tenê "seluloz") .

CesA ji hêla nebatan ve di encama endosymbiosisê de ku kloroplast çêdibe hate bidestxistin. Malbata 2 ya glucosyltransferases ev yek (GT2) dihewîne.

Piraniya biyomasa li ser Erdê bi rêya biosentez û hîdrolîzê ji hêla enzîmên bi navê glycosyltransferases ve tê hilberandin.

Tê zanîn ku supermalbata CesA di nav de ye. heft binemalbat, û supermalbata nebat-algal a hevgirtî 10 dihewîne.

Tenê koma ajalan ku xwediyê vê enzîmê yeurochordates, ku ji 530 mîlyon sal berê bêtir bi veguhestina genê ya horizontal wergirtiye.

Sentaza Cellulose (GDP-Forming)

Ev enzîm endamek ji binmalbata hexosyltransferase ya glycosyltransferases e. Ev çîna enzîmê bi navê xwe yê zanistî, GDP-glucose:1,4-beta-D-glucan 4-beta-D-glucosyltransferase tê binav kirin.

Navên din ên ku bi gelemperî têne bikar anîn ev in cellulose synthase (çêkirina guanosine diphosphate), cellulose synthetase, û guanosine diphosphoglucose-1,4-beta-glucan glucosyltransferase. Ev enzîm tev li metabolîzma sukroz û nîşah dibe.

Synthetase Çi ye?

Peyva "senthetase", ku carinan wekî "lîgaz" tê zanîn, yek ji çînek bi qasî 50 enzîman vedibêje ku reaksiyonên parastina enerjiya kîmyewî katalîze dike û navbeynkariyê di navbera bûyerên hilweşandina enerjiyê û hilberînê de dike. pêvajoyên sentetîk.

Bi qutkirina girêdanek fosfatê ya enerjîk, ew enerjiya pêwîst ji bo katalîzasyona yekbûna du molekulan çêdikin (di pir rewşan de, bi veguheztina hevdem a adenozîn trifosfat [ATP] bo adenozîn dîfosfat [ADP]) .

Lîgaza ku bi navê asîda amînî-RNA lîgaza tê zanîn yek e ku çêkirina girêdanek karbon-oksîjenê di navbera RNAya veguheztinê û asîdek amînî de katalîz dike.

Dema ku hin enzîm, wekî amîd sentetaz, û sentetazên peptîd çalak bin, karbon-nîtrojen (C-N)girêdan têne hilberandin.

Synthetase wekî Ligase jî tê zanîn

Cûdahiya Di Navbera Synthetase û Synthase de

Sinthetase enzîmek e ku dikare tevlîheviya bi hev re katalîz bike. du molekulên mezin bi afirandina girêdanek kîmyayî ya nû, bi gelemperî bi hîdrolîza hevdem a komek kîmyewî ya piçûk a li ser yek ji molekulên mezin re, an jî ew dikare girêdana du pêkhateyan, wek hevgirtina C-O, C-S, C-N, hwd.

Lîgaz bi gelemperî dibe sedema reaksiyona jêrîn:

• A-C + b = Ab + C
• A+D + B + C + D + E + F = Ab + cD

Cihê ku komên girêdayî, piçûk bi tîpên piçûk têne xuyang kirin. Ligase dibe ku şikestinên yek-zindî yên ku di ADN-ya du-zindî de di dema dubarekirinê de çêdibin tamîr bike û hem jî du perçeyên asîda nukleîk ên temamker bi hev ve girêbide.

Ji hêla din ve, synthase enzîmek e ku di biyokîmyayê de pêvajoya sentezê katalîze dike. Ew li gorî kategorîzekirina hejmarê EC-ê di kategoriya lyases de ne.

Navdêr

Bînin bîra xwe ku navdêra biyolojîkî di destpêkê de di navbera synthetases û synthases de cihê dike. Li gorî pênaseya orîjînal, synthetases trifosfatên nukleozîd (wek ATP, GTP, CTP, TTP, û UTP) wekî çavkaniyek enerjiyê bikar tînin dema ku synthases nakin.

Digel vê yekê, li gorî Komîsyona Hevbeş ya Navoksaziya Biyokîmyayî (JCBN), "synthase"